transform模块

软件版本:5.1.0
问题描述:最近在使用3dslicer进行配准,里面有个elastix模块可以一键配准。在配准ADC时,先用DWI配准生成了transform转换矩阵,但是我发现这个transform不好用啊,在transform模块里,用刚刚生成的转换矩阵将配准前的图像进行变换,发现得到的图像竟然和配准后得到的图像不一样啊,,应用在ADC图上 的配准效果也不行,有大佬对于像ADC的配准有更好的办法吗?

是将T1和DWI或ADC进行配准吗?可以尝试一些改进的方法。以下是一些可能有帮助的建议:

  1. 切换固定图像和移动图像:考虑将T1作为移动图像,而不是ADC图像。这是由于T1和ADC的分辨率存在差异,以T1作为移动图像可能更有意义​1​。

  2. 试用不同的配准参数:在Elastix模块中,可以尝试调整一些参数,如splineGridSize。如果你发现默认的参数值(例如,4,4,4)无法得到满意的结果,可以试着修改这些参数值。一个用户在论坛中分享了他的经验,他发现当参数splineGridSize设为7x7x4时,配准结果更好,这是因为体素并非各向同性的​1​。

  3. 注册不同的图像:如果应用DTI图像配准的话,需要b0图像的话,可以考虑先将其注册,然后将相同的变换应用到ADC图像上。一个用户分享了他的经验,他发现将T1w图像注册到b0图像上,虽然这样并不能纠正Eddy畸变,但是由于他是在各个区域上计算统计量,所以这种方法应该足够好​1​。

  4. 有选择地使用ROI/mask:有时候,使用ROI/mask可能会影响到配准结果。可以试着在没有ROI/mask的情况下进行配准,看看结果是否有所改善​1​。