天天练002-场景数据、体数据保存

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知识点:

NRRD数据表示图像的所有信息。

3D Slicer除了对DICOM数据支持外,还对Analyze和NIfTI数据提供支持。

Analyze格式储存的每组数据组包含2个文件,一个为数据文件,其扩展名为.img,包含二进制的图像资料;另外一个为头文件,扩展名为.hdr,包含图像的元数据。

Analyze格式是fMRI早期最常用的格式,现在逐渐被NIfTI格式所取代。Analyze格式的缺点是头文件不能真正反映元数据。

NIfTI格式最重要的特征是能反应MRI的像素指数与空间位置。标准NIfTI图像的扩展名是.nii,包含了头文件及图像资料。

单独的.nii格式文件的优势就是可以用标准的压缩软件(如gzip),而且一些分析软件包(如FSL)可以直接读取和写入压缩的.nii文件(扩展名为.nii.gz)。

1 个赞

请问这里的“反应像素指数”怎么理解?期待您的指导

知识点来源于网页:http://www.cnblogs.com/yanghelin/p/8708456.html

因非医学影像专业,对于像素指数也无法做出确切的定义,只是大概的理解意思,不影响对软件的使用就可以了。也期望大家遇到问题的时候,自己先查找一下,发帖普及也惠及别人,提高效率,节省的时间更多的用于软件的普及而非对个别专业术语的纠结。


我点开SAVE 看到是这个界面,能告诉我以上数据都说明什么?
我该怎么操作下一步吗?

MRMl为场景数据,nrrd为体数据,png为图像数据,最常用的保存形式是nrrd格式的体数据保存。

勾选需要保存的文件,更改保存文件路径后,点击“Save”进行保存。

点了,点保存的时候出现了这个界面,是不是说明保存不了?

点了yes后又弹出这个,意思大概也是导不出数据啊?

搞懂上面的问题了 :joy: ,原来是中文目录的原因 :sweat:

save后文件夹里出现了

这些文件;然后下一步是吧这些文件重新导入slicer吗?

导入后出现的是

为什么出现这样的情况?

2SS30.nrrd应该是体数据文件,而999 Dose Report.nrrd貌似是报告模板样影像数据。

你导入的数据名称B:Ma…,并不是你存储的数据2SS30.nrrd,导入过程自己仔细查看一下出现的具体原因,现在无法分析,除非将所有文件打包发我才能知道。

我弄明白我之前出现的问题了。
之前我没用练习题里面的素材,自己从办公电脑上拷贝数据
(本站里面有一篇专门教怎么从华海系统拷贝数据的文章)
拷贝下来的数据中有很多不同的数据(包括报告,影像和一些其它信息),
所以会出现上述情况
我用练习素材弄的话,就没问题了(之前没注意看有练习素材)
感谢曹主任的教导

数据保存路径可以更改的吧?不影响下次数据的使用,因为默认保存在C盘。

可以更改,参见天天练001的思考题答案

也可以这么改保存路径。

保存的文件只有一个HCTA001,nrrd


保存时遇到这个问题,不知道怎么回事?请老师们回复一下

保存时更改一下目录试试

image

请问这个问题应该如何解决?我已经试过了中英文的保存路径,都不行;我现在是在我的笔记本上画的

绝对不能应用中文路径的,包括系统用户的登陆名为中文都不行。

保存过程中遇到问题吗?此类问题可能个别版本问题,尝试应用其他版本。