天天练048-脑组织建模

此课练习不过关啊,试试spm软件,上面的帖子

spm好像是基于python的一个软件,交通仁济医院有一个人在用这个软件,但是我觉得要重新去涉及一款计算机语言难度还是比较大的,我这边之前也有用freesurfer配置环境并处理过患者的mr数据,可以用的几个模型也是能很漂亮的配置出患者的脑皮层,但是数据处理花费的时间很大(看电脑配置至少要五个小时以上),而且freesurfer是基于linux和ios系统上的,在window用的话上必须装一个linux的虚拟机,所以本人觉得还是比较繁杂的,曹老师我后来自己就是用editor的工具一步步也画出来了脑白质,只是想知道怎么样方便快捷的画出脑白质组织,可能是我前面没学认真有些地方遗漏了,

这一张是我用freesurfer处理过的患者数据,下面我放一张我自己用editor笔刷工具一步步画出来的脑白质情况差不多,但是很费时间,想知道有什么更好的方法,比如利用阈值之类的东西呢,请曹老师指教,下面这张是我自己裁剪画的,这个是我刚开始摸索3d时候用很笨的方法一笔一笔画的!

并且只能保存裁剪后的mr场景

曹老师我们建模之后能不能对这些图像进行裁剪呢,我好像看了教程没有看到裁剪的教程,因为我们先看整提后看局部,想对局部进行扩大建模并区分开来,应该怎么做呢曹老师!

应用Segment Editor模块能够完成。

相应的教程有吗,曹老师请发个链接,我知道segment里面又几个剪刀的选项但是具体还是不怎么会用

现成的教程没有,自己看看官网学习一下。

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曹老师,为何按照您的步骤重建的都看不出脑组织?感觉不太光滑

首先确定数据是否一致,如果用你自己的数据,可能原因是数据扫描不够薄,我用的CTA数据是0.625扫描。其次软件使用过程中有一些技巧,需要自己体会。还有就是模型的光滑度可以进行一些参数设置及平滑操作。

好的,谢谢曹老师


曹老师,您说的对,昨天用的别人的数据,今天换了自己的数据,层厚1mm,果然就出来了。谢谢老师。

你好,这个很漂亮的,有没有具体的教程。求赐教。

请问曹老师,一键去骨在哪?

老师您好,CTA的数据有可以公开使用下载的吗?

不懈努力哦,通过MASK volume,脑建模,终于接近了。曹主任,指导下。血管颜色还不是很完美。

曹主任,请您指导下,合格不?在image 模块中使用阈值法及image

建脑组织模型,第一幅是CTA建的,第二、三幅是MRI建的。

:+1:

如果其他人感兴趣可参阅系列教程:

https://forum.slicercn.com/c/27-category/27

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感谢曹主任的细心指导。思考题1的成果。自己感觉主要是对每个工具的使用要深刻理解和灵活应用。

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