3DSlicer扫盲18问
1、什么是3DSlicer？
3DSlicer是：
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用于医学图像的分析（包括配准和交互式分割）和可视化（包括3D渲染）以及用于图像引导治疗研究的软件平台。
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适合多种操作系统的免费开源软件：Linux，MacOSX和Windows。
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可扩展，具有强大的插件功能，可添加算法和应用模块。
功能包括：
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多器官：从头到脚。
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支持多模态成像，包括MRI、CT、US、PET、超声和核医学等。
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设备的双向接口。
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可以对病灶进行建模、3D打印，定位、制定手术规划、手术预演、与家属交代病情、多模态融合（比如镰旁脑膜瘤患者将肿瘤、纤维束、动脉、静脉全部融合在一起）。
使用没有任何限制，目前多应用于研究，发文章不错哦。
2、我在哪里可以下载3DSlicer？
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可以通过访问官方网站下载3DSlicer：https://download.slicer.org
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您还可以使用下载页面中的offset参数获取旧版本。例7天前的下载页面：https://download.slicer.org/?offset=-7
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国外服务器下载失败可以在国内服务器上进行下载，网址为：3DSlicer软件下载链接专用贴
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下载页面包含以下参数：
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稳定版本，旧版本，预览版
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操作系统：windows、macosx或linux
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版本号：version ～
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修订版本号：revision ～
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修订日期：built ～
3、我在哪里可以下载更早版本的3DSlicer？
旧版本的3DSlicer下载地址：
http://slicer.kitware.com/midas3/folder/274
4、3DSlicer是否有中文版本？
虽然3DSlicer社区曾对早期版本进行了汉化工作，但由于3DSlicer版本更新速度太快，新版本又增加了很多新的模块，并且针对以往的Bug做了改进，算法得到了优化。限于精力目前不再进行中文版本的更新工作。Slicer使用美国英语惯例，目录路径仅能使用ASCII字符，所以不能有中文的文件目录和路径，也不支持中文的文件名。
5、如何安装Slicer？
打开下载网页：http://download.slicer.org，单击与您操作系统对应的链接进行下载，操作系统必须是64位的。
Linux系统： 根据需要替换以下命令中的版本
”(replace version number as appropriate)”
$ tar xzvf ~/Downloads/Slicer-4.6.2-linux-amd64.tar.gz -C ~/
$ cd ~/Slicer-4.6.2-linux-amd64
$ ./Slicer
关于某些Linux发行版的注意事项可能需要额外的软件包，例如对于Debian Linux 9上的Slicer 4.9，如果您遇到错误的库，则可能需要运行此命令：
sudo apt-get install libpulse-dev libnss3 libasound
Windows系统： 双击下载的Slicer-4.10.2-win-amd64.exe程序，按照屏幕上提示进行安装即可。
Mac OSC系统： 双击下载的Slicer-4.10.2-macosx-amd64.dmg程序包，拖放Slicer.app到桌面或应用程序中。
注：3DSlicer不能应用在安卓或苹果的手机系统。
6、3DSlicer真的免费吗？
3DSlicer是真正免费使用的，而且开放源代码，并没有像其他软件试用版本的功能缩减。
7、我在哪里可以找到3DSlicer爱好者？
官方有一个Slicer社区开放论坛，英文交流。
国内我们也建了一个Slicer中文论坛，注册人数超过2500人，中文交流更方便。
同时我们还有四个微信交流群，如果您对3DSlicer感兴趣，可以加caoyufu微信好友，注明姓名医院专业，方便拉入微信群进行交流学习。
8、我可以使用3DSlicer对病人进行治疗吗？
在美国3DSlicer目前用于研究工作，没有FDA批准或任何其他组织的批准应用于临床。使用3DSlicer的用户有责任遵守当地所有法律法规以及道德和伦理准则。在国内不建议将3DSlicer作为诊疗的唯一手段。
9、3DSlicer无法启动怎么办？
在Slicer-4.10中运行Slicer的计算机必须支持OpenGL 3.2，在Windows 10上运行的英特尔集成GPU和一些NVidia GPU（Quadro系列）现在均支持运行当前的OpenGL版本。但是，在虚拟机上或通过远程桌面连接到计算机时，可能无法满足此最低要求。另外操作系统需为64位系统。
10、如何卸载Slicer？
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在Windows上，从“开始”菜单中选择“卸载”选项。要清理设置和扩展模块，请删除“C:Users〜AppDataRoamingNA-MIC”
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在Mac上，删除Slicer.app文件。要清理设置，请删除“〜/ .config / www.na-mic.org /”
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在Linux上，删除应用程序所在的目录。要清理设置，请删除“〜/ .config / NA-MIC /”
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注：“〜”为用户名
11、我在哪里可以找到3DSlicer教程？
- 可通过访问以下链接获得与最新4.10稳定版本相关的3DSlicer英文教程： https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Training
- 中文用户可以访问“ 临床影像实践 ”，网址为：https://www.slicercn.com，原来的名称3DSlicer社区，因包含英文名称和社区字样，审核无法通过，现在停用。
- 可以在3DSlicer中文论坛中发帖提问及交流使用经验，网址为：https://forum.slicercn.com。
- 可以关注公众号：3DSlicer社区（SlicerCN）不区分大小写，里面有很多零基础的教程和临床应用案例。
12、我应该使用哪种3DSlicer版本？
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通常情况下Slicer3和Slicer4在基础操作方面具有大致相似的功能，但是Slicer3版本不再被主动维护。
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Slicer4在过去几年中已经修复了数百个错误，不仅扩展了功能，而且经过优化获得了更好的性能。而且sliceer4现在使用ITKv4，其在许多情况下能提供更好的结果。
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目前建议应用稳定版：Stable Release:4.10.2（修订版28257），需要注意的是稳定版的修正版本号也在更新。
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如果想尝试更多新加入的功能模块，可以同时在电脑中安装预览版。
13、3DSlicer能够应用的数据都有哪些格式？
3DSlicer能够应用的最基本的格式为DICOM，DICOM格式包含有患者姓名、医院、检查日期、扫描方式、层厚等参数，通常CT和MRI扫描都会生成DICOM格式。我们要取得这些数据最简洁的方式是通过PACS系统，或者到影像科刻录光盘。其次Slicer也可以处理nii、nii.gz、nrrd、img等格式。
3DSlicer也可以处理一系列的jpg、tiff或png格式，但需要知晓图像的比例尺和层厚数据，处理的效果远不如DICOM。具体载入方法请参照公众号SlicerCN中的相关文章。
14、为什么没有开发Windows 32位程序？
Win 32的应用程序可用内存非常有限，不超过4G，某些算法会将内存耗尽而导致电脑死机。而3DSlicer运行的内存最小要求应该是8G，因为硬件的原因但用户会以为是3DSlicer软件的问题，所以官网也不提供32版本的更新。
15、轴位图像很清晰，但是冠状位和矢状位图像模糊什么原因？
应用于3DSlicer三维重建的数据仅需要轴位、矢状位或冠状位其中之一即可。如导入到3DSlicer中的图像为轴位图像时，3DSlicer会根据轴位图像重建矢状位和冠状位图像，此时如果轴位图像扫描层厚偏大时，轴位图像为原始图像，一般会很清晰，而重建之后的矢状位和冠状位图像则会模糊。要想达到满意的重建效果，建议影像扫描层厚1mm以下，血管重建建议0.625mm。
如下图所示为扫描层厚5mm的头颅CT数据重建效果，原始数据为24幅轴位图像。
下图为扫描层厚0.625mm的头部CTA数据重建效果，原始数据为579幅轴位图像（包括头颈部）。
16、导入数据后界面无图像显示是什么原因？
- 首先要检查一下数据目录及路径是否为中文，文件名是否为中文，3DSlicer软件不支持中文。
- 导入出错的其他原因可以参照公众号文章，数据导入教程。也可在3DSlicer中文论坛中搜索“数据”查看相关文章。
- 数据导入的4种方法：https://forum.slicercn.com/t/topic/265
- 也可以应用第三方软件转换成nii、nii.gz格式后再导入到3DSlicer中。常用的软件有Mango、Dcm2nii、MRIConvert等，3DSlicer中文论坛中均有下载地址。
17、安装3DSlicer后界面缺少一些插件怎么办？
我们习惯将3DSlicer中的插件称作模块，一些模块是3DSlicer自带的，还有100多个模块是需要在线进行安装的。具体的安装方法可以参照3DSlicer中文论坛中的“关于扩展模块（插件）问题汇总”贴，论坛搜索“模块”即可。
18、什么样配置的电脑能够流畅运行3DSlicer软件？
主流的游戏本电脑为首选，建议多核CPU、内存至少8G，独立显卡GTX1060 4G显存以上配置，最好再配置一块SSD硬盘，读取数据会更快，笔记本电脑屏幕建议15.6英寸或17.3英寸（便携性差）。
推荐几款配置：
- 神州战神Z7-CT5NS：i5-9300H/GTX1660Ti/16G内存/512G SSD/窄边框/15.6吋IPS屏（性价比高）
- DELL G系列G3（旧模具性价比高) 15.6英寸游戏本i7-9750H 16G内存 512G SSD GTX1660Ti MQ6G独显 FHD屏幕（上门售后，只换不修，可以延保）
- DELL G系列G7（新模具更好看） 17.3英寸高端游戏本 G7 7790-R1785B i7-9750H 16G内存 512G SSD RTX 2070MQ 8G独显 FHD屏幕（比外星人性价比高）
- 注：以上推荐仅作为2019年购买笔记本电脑的参考，因硬件升级很快，2020年很快这样配置就不是主流了，以上仅供大家参考，因购买后出现质量及体验问题，本人概不负责。
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转载自: 临床影像实践 - 3DSlicer扫盲18问