DTI教程08-纤维束成像(胼胝体)

一、纤维束成像:

这个模块可以对感兴趣的区域进行纤维束成像,可以在FA图中定义感兴趣区域(ROI),以胼胝体纤维束成像进行讲解。

应用到模块imageimage


二、胼胝体标签图:

1、在切片视窗控制界面将前景层选为DTI,透明度系数设置为0.40。背景层选为FA,其叠加后效果如下图所示。

2、进入到Editor模块,主体数据选取FA,融合体数据自动命名为FA-label。

3、利用绘画工具对胼胝体进行描绘。

4、按照上面方法对胼胝体至少描绘3~5个层面。

三、参数设置:


Parmeters Node:参数节点

  • Parameters(参数):选择模块的现有设置或创建一个新的设置。
  • Presets(预设):为模块选择Slicer4或Slicer3参数设置,目前版本共有3个选项。
    • Slicer4 Interactive Seeding Defaults:默认Slicer4交互种子。
    • Slicer3 Labelmap Seeding Defaults:默认Slicer3标签映射种子。
    • Slicer3 Fiducial Seeding Defaults:默认Slicer3基准点种子。

IO:IO面板-输入输出参数设置

  • Input DTI Volume(输入DTI数据):选择现有的张量数据(DTI)。
  • Output Fiber Bundle(输出纤维束):默认为“FiberBundle”,示例选择“Create new FiberBundle as…”并命名为“FB-Brain”

Seeding:种子

  • Input Fiducials,Model or Label Map:选择一个现有的基准点列表、模型或标签映射体数据作为跟踪的种子。
  • Seeding Label Value:种子标签值,默认为1。
  • Seed Spacing(mm):种子间距,表示选取种子间的距离,单位为毫米,这个功能只有在没有勾选使用索引空间复选框时才有效。
  • Use Index Space:使用索引空间,勾选后在IJK中选择体素作为种子。
  • Random Grid:随机网格,勾选后能够随机放置种子点。

Update:更新

  • 点击“Update”即可在三维视窗中观察纤维束成像情况,调节各参数后,需要重新点击“Update”。

四、胼胝体成像方法:

参数设置如下,其他参数为默认。

  • Presets:预设默认为 Slicer4 Interactive Seeding Defaults
  • Input DTI Volume:选择张量数据DTI
  • Output Fiber Bundle:选择“Create new FiberBundle as…”并命名为“FB-CC”

操作步骤:

备注:点击图片可以查看清晰大图。

五、参数调节:

Seed Spacing(种子间距)表示选取种子间的距离,单位为毫米,这个功能只有在没有勾选Use Index Space(使用索引空间)复选框时才有效。

备注:点击图片可以查看清晰大图。


教程链接:

1、DTI教程01-数据转换

2、DTI教程02-DWI数据加载

3、DTI教程03-大脑掩膜及基准体数据输出

4、DTI教程04-计算弥散张量

5、DTI教程05-弥散张量的标量测量

6、DTI教程06-弥散张量的可视化

7、DTI教程07-大脑纤维束成像

8、DTI教程08-纤维束成像(胼胝体)

9、DTI教程09-纤维束成像(胼胝体)的参数调节

其他链接:

1、教程素材 Dti_tutorial_data(DTI)

2、DTI美图

3、3DSlicer导入DTI数据出现问题求大神指教

4、DTI数据导入问题请教

曹老师,DTI合成时遇到这个问题,尝试了下载XnConvert,好像不能预览,求指教
无法更改为像素数据的未封装表示
E:无法确定解压缩图像的“PhotometricInterpretation”
E:强制属性’PhotometricInterpretation’缺失或无法确定
E:无法更改为像素数据的未封装表示
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E:无法更改为像素数据的未封装表示

老师,怎么设置Fa?