影像组学中binwidth的设置

软件版本:5.3.0
问题描述:提取放射组学特征时,如何设置一个最佳的binwidth。

在放射组学中设置最佳的bin width对于灰度量化和特征提取至关重要。以下是一些在线文档和资源,它们提供了有关如何选择或优化bin width的信息:(蓝色字体是文献的链接)

  1. 灰度值离散化: 在PyRadiomics和SLICER RADIOMICS中,bin width参数用于灰度值的离散化。推荐的bins数量大约在16-128个之间,这与之前提到的在大多数扫描中使得bin数量在10-100之间的建议相吻合​1​。
  2. 查看一阶范围: 查看firstorder:Range的值是一个常见的方法,以确定合适的bin width。这种方法可以通过将range除以bin width,并尽量保持结果的bins数量在推荐的范围内来选择bin width2​。
  3. 特定图像类型的建议: 根据图像的类型,例如PET或MR图像,可能需要选择不同的bin width值。对于PET图像,建议的bin width为0.4​3​。而对于MR图像,一个例子是,如果firstorder - Range的值是50 - 500,那么使用bin width 5​1​。
  4. 目标bin数量: 选择bin width时,目标是产生一定数量的bins,例如30到128个bins,这也与前面提到的在大多数扫描中使得bin数量在10-100之间的建议相吻合。这种方法的目的是确保灰度值的离散化具有良好的再现性和性能​4​。
  5. 实例应用: 在一个具体的实例中,当firstorder - Range的最小值为1.46,最大值为7.58时,建议的bin width值为0.1,这将为最小和最大值产生分别为15和76的bins,都在推荐的bins数量范围内​1​。

综上所述,选择或优化bin width主要依赖于要分析的数据集的特性和图像类型。同时,应考虑目标bin数量以确保灰度值的离散化质量。虽然有一些通用的建议和方法,但可能还需要根据具体的数据集和分析目标进行进一步的优化和验证。