使用配准模块对同一个患者的两次CT进行配准出现了问题

软件版本:4.11
问题描述:同一个患者在不同时间扫描的CT摆位时位置有些差别,想用软件中的刚性配准抵消摆位造成的误差,但是使用Brain和Elastix进行刚性配准时,移动后的区域会有灰色条带,我如果在Brain模块将背景填充为-1024以后,配准后的图像就会少一块,请问有没有人知道这个怎么解决?



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灰色条带可以尝试应用crop Volume模块剪切掉,或者在Segment Editor模块中利用mask Volume去除。

好的,谢谢曹老师!为了保证两个CT的位置尽可能的对应上,我目前是在Volume Rendering中将CT的床板从ROI中去除,然后用Crop Volume将2个CT的床板以及一个CT多余的部分给去除了,这样操作可以吗?

曹老师,还有一个问题想叨扰您。在Transforms模块我创建了一个新的LinearTransform,想对CT进行旋转和平移等刚性变换,但是我在Apply transfrom这里点击绿色向右箭头以后又点击了下边的Harden transfrom,将CT保存以后,再导入到3DSlicer中,CT的Image Origin 是变了的,但是图像在Slicer的界面并没有显示平移和旋转,还是跟原来一样(我大概半年前用这个操作试过,当时保存再导入以后是可以看到图像有平移和旋转的)。不知道曹老师是否知道这个问题是怎么回事?
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上述步骤没有问题,之后再应用crop Volume进行一次采样即可。

曹老师,为什么要再进行一次采样呢?我用crop Volume生成的文件我看Spacing啥的好像跟原来的图像都是一样的,就是稍微有点模糊了(应该是配准过程中有重采样)

解决配准后图像没有变化的bug,图像模糊为配准后图像旋转导致,而非采样。

噢噢,好的,谢谢曹老师!