3DSlicer如何使用 TomoSAM 扩展

如何使用 TomoSAM 切片器扩展

这些是使用 TomoSAM 生成分割的常用步骤:

  • 将 .tif 图像和 .pkl 嵌入放在同一个文件夹中,并使它们的名称相同,例如 test.tif 和 test.pkl
  • 打开切片器,然后从下拉Modules 菜单中选择SegmentationTomoSAM
  • 将图像拖放到 Slicer 中,它也会自动导入嵌入
  • 在三个切片查看器(红色/绿色/黄色)之一中添加包含点以创建蒙版并添加排除点以优化它
  • 添加一个点后,所选切片将被冻结,直到不存在任何点或Accept Mask 按下按钮
  • 通过单击添加与对象一样多的段Add Segment
  • 使用Create Interpolation 按钮在创建的蒙版之间进行插值
  • 表面渲染不会自动更新以减少延迟:单击按钮Render 3D 更新 3D 视图

请注意,您可以使用 中的小部件进一步修改在 TomoSAM 中创建的蒙版Segment Editor ,例如 Paint 或 Erase。此外,请注意已添加多个键盘快捷键 Info help 以简化分割过程(有关快捷键列表,请参阅TomoSAM 中的按钮)。

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