教学大纲
了解场景、节点、模块、扩展模块
模块
- 扩展模块下载
- 扩展模块在线安装
- 扩展模块离线安装
- 核心模块设置
数据
- 数据类型
- 示例数据
- 数据库
- 自动保存
- 元数据
场景：Slicer将所有加载的数据存储在数据库中，称为“场景”（MRML场景）。
节点：每个数据集（例如容积数据，分割体或模型）在场景中表示为“节点”。
模块：Slicer提供了大量的“模块”，每个模块都实现了一组特定的功能，用于在场景中创建或操作数据。
模块通常不直接相互交互，它们只对相同的数据进行操作，这些数据存储在场景中。
切片器包包含100多个内置模块。
扩展模块：需要进行单独安装，可以使用Extension Manager安装扩展模块（4.13版本有140多个扩展模块）。
扩展模块
扩展模块网络下载地址（更换后面的版本号）
http://slicer.kitware.com/midas3/slicerappstore?layout=empty&os=win&arch=amd64&revision=29738
os用 ( win , linux , macosx )替代，revision是版本号：https://extensions.slicer.org/catalog/All/<revision>/<os>
https://extensions.slicer.org/catalog/All/29738/win
https://extensions.slicer.org/catalog/All/29738/macosx
常用扩展模块
Cameras：
SlicerVideoCameras
Chest Imaging Platform：
Chest_Imaging_Platform
LungCTAnalyzer
DICOM:
DCMQI
Diffusion
SlicerDMRI
SlicerDcm2nii
Diffusion Process
DiffusionQC
Diffusion Tractography
UKFTractography
Informatics
CurveMaker
DICOMwebBrowser
MarkupsToModel
QuantitativeReporting
Machine Learning
DeepInfer
Quantification
FiducialsToModelDistance
Radiotherapy
SlicerRT
Registration
CMFreg
SegmentRegistration
SlicerElastix
Rendering
SlicerPRISMRendering
Segmention
Autoscroll
NvidiaAIAssistedAnnotation
SegmentEditorExtraEffects
SkullStripper
SurfaceWrapSolidify
SwissSkullStripper
VolumeClip
Shape Regression
AnglePlanesExtension
BoneThicknessMapping
EasyClip
MeshToLabelMap
Surface Models
ModelClip
ModelCropper
Training
PedicleScrewSimulator
Vascular Modeling Toolkit
SlicerVMTK
数据类型
-
DICOM 数据
- 医学数字成像和通信（ Digital Imaging and Communications in Medicine ,DICOM）
- 是医学成像信息和相关数据的通信和管理的标准。
- DICOM用于存储和传输医学图像。
- 在大多数情况下，医院中使用的成像设备（CT和MR）将生成保存为DICOM格式的图像。
- 取得DICOM数据的方法：PACS、光盘、U盘等。
-
非 DICOM 数据，涵盖从图像（nrrd、nii.gz、…）和模型（stl、ply、obj、vtk、…）到表格（csv、txt）和点列表（json）的所有类型的数据。
-
加载可以通过两种方式进行：在应用程序窗口上拖放文件，或使用工具栏上的加载数据按钮
。 -
使用“保存数据”工具栏按钮 进行保存
。
