N4偏置场校正这些选项和参数应该怎样设置？谢谢各位老师

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问题描述：N4偏置场校正这些选项好参数应该怎样设置？

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参考文献：https://www.insight-journal.org/browse/publication/640

N4ITK MRI 偏差校正

概述

使用 N4 算法执行图像偏差校正。该模块基于以下出版物中贡献的 ITK 过滤器：Tustison N, Gee J “N4ITK：Nick 的 N3 ITK 实施 MRI 偏置场校正”，洞察期刊 2009 年 1 月至 6 月，http ://hdl.handle.net /10380/3053

面板及其用途

IO：输入/输出参数

  • 输入图像 （inputImageName ）：观察信号不均匀的输入图像
  • 掩码图像 ( maskImageName )：定义您感兴趣的结构的二进制掩码。注意：此参数是可选的。如果未指定掩码，模块将使用内部 Otsu 阈值来定义此掩码。当定义一个有意义的掩码时，通常可以获得更好的处理结果。
  • 输出体积 （outputImageName ）：处理结果
  • 输出偏置场图像 （outputBiasFieldName ）：恢复的偏置场（可选）

N4参数：

  • BSpline 网格分辨率 （initialMeshResolution ）：定义为三个数字序列的初始 bspline 网格的分辨率。实际分辨率将通过将 bspline 阶数（默认为 3）添加到此处指定的每个维度中的分辨率来定义。例如，1,1,1 将产生一个 4x4x4 的控制点网格。此参数可能需要根据您的输入图像进行调整。在多分辨率 N4 框架中，bspline 网格在后续迭代中的分辨率将翻倍。分辨率的数量由迭代次数参数隐式定义（此列表的大小为分辨率的数量）
  • 样条距离 ( splineDistance )：通过设置控制点之间的距离来定义样条网格的另一种方法。仅当未指定网格分辨率时才使用此参数。
  • 偏置场半高全宽 ( bfFWHM )：偏置场半高全宽。零意味着使用默认值。

Advanced N4 Parameters：算法的高级参数

  • 迭代次数 （numberOfIterations ）：每个分辨率级别的最大迭代次数。较大的值会增加执行时间，但可能会导致更好的结果。
  • 收敛阈值 （convergenceThreshold ）：迭代偏差估计的停止标准。较大的值将导致较短的执行时间。
  • BSpline order ( bsplineOrder )：近似中使用的 B 样条的顺序。较大的值将导致更长的执行时间，可能导致过拟合和较差的结果。
  • 收缩因子 ( shrinkFactor )：定义在估计不均匀场之前应该对图像进行多少上采样。如果要减少执行时间，请增加。1 对应于原始分辨率。较大的值将显着减少计算时间。
  • 权重图像 （weightImageName ）：权重图像
  • 维纳滤波器噪声 （wienerFilterNoise ）：维纳滤波器噪声。零意味着使用默认值。
  • 直方图 bin 的数量 ( nHistogramBins )：直方图 bin 的数量。零意味着使用默认值。