第20课时:血管中心线虚拟内镜

教学大纲


:one: Extract Centerline


:two: Cross-Section Analysis


:three: Curve Centerline Extraction


:four: Fiducial Centerline Extraction


:five: Centerline Computation


:six: Endoscopy


https://github.com/vmtk/SlicerExtension-VMTK

VMTK模块

数据:Sample Data/CTACardio

SlicerVMTK 扩展提供以下模块:

  • 分割:
    • 血管过滤:图像处理操作,可增加管状结构的亮度并抑制其他形状(板和斑点)。该模块可用于预处理图像数据,使血管分割更容易。
    • 水平集分割:该模块可以从图像中分割血管树的单个血管分支 (可以使用未处理的或血管过滤的)。将“种子”点放置在容器内,并将“塞子”点放置在要避免的区域(分割泄漏到的地方)。要分割多个分支,您可以使用 Segment Editor 模块。
  • 分析:
    • Extract Centerline(提取中心线):从输入分段或模型节点确定血管树中的中心线。它既可以进行快速网络提取,也可以进行精确的中心线计算和指定端点之间的分支提取。该模块可以简化输入以加快计算速度(通常为 5-20 秒)而不会显着降低精度,还可以检测和标记网格错误(非流形边缘)。
    • Cross-Section Analysis(横截面分析):沿中心线曲线重新切片图像、分割或模型。它可以测量横截面积和各种其他指标,并将其显示为表格或图表。
  • 工作流程:
    • Curve Centerline Extraction(曲线中心线提取):使用标记开放曲线从对比增强的 CT 血管扫描中创建目标分割,并最终从表面模型中提取中心线。总体而言,它是一个小包装,可将 动脉段创建为 管,然后提取中心线。
    • Fiducial Centerline Extraction(基准中心线提取):使用基准点从对比增强 CT 血管扫描中创建目标(小)分割,并最终从表面模型中提取中心线。总的来说,它是常见动脉分割任务的一个小包装。

支气管虚拟内镜

数据:培训数据\013肺动脉及肺部数据\支气管分割数据