第30课时:影像组学特征提取

教学大纲


:one: Radiomic Features


:two: https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/


:three: https://discourse.slicer.org/c/community/radiomics/23


提取130个特征

可以输出为Table表格

使用 PyRadiomics 提取的各种特征的定义。它们细分为以下几类:



您可以通过三种方式使用 pyradiomics:

  1. 通过 pip 安装

  2. 从源代码安装

  3. 使用 3D Slicer Radiomics 扩展

  4. 使用 pyradiomics Docker

https://www.youtube.com/watch?v=ZF1rTtRW3eQ&t

Params.yaml配置文件进行了文件归一化,可以提取1800多个特征


Params.yaml (365 字节)



setting:
  binWidth: 25
  label: 1
  normalize: True
  interpolator: 'sitkBSpline'
  resampledPixelSpacing:
  weightingNorm:
imageType:
  Original: {}
  Wavelet: {}
  LoG: {sigma: [0.5, 1.0, 2.0, 3.0, 4.0]}
  Square: {}
  SquareRoot: {}
  Logarithm: {}
  Exponential: {}
  Gradient: {}
featureClass:
  shape:
  firstorder:
  glcm:
  glrlm:
  glszm:
  gldm:
  ngtdm: