Resample Scalar/Vector/DWI Volume模块用法

使用3D Slicer的Resample Scalar/Vector/DWI Volume模块命令参数如下:

  1. 输入/输出参数
  • 输入体数据(Input Volume):要被重采样的输入体数据。
  • 输出体数据(Output Volume):重采样后的体数据。
  • 参考体数据(Reference Volume):用于设定输出参数(间距、大小、方向、原点)的参考体数据。
  1. 变换参数:用于将输入图像转换为输出图像的参数:
  • 变换节点(Transform Node)。
  • 变形场体数据(Deformation Field Volume):包含有3个分量的向量的3D向量图像的文件。
  • 位移或H-场(Displacement or H-Field):如果变形场是H场,则进行设置。
  1. 插值类型:选择采样算法,包括线性(linear)、最近邻(nn)、窗函数同步(ws)和B样条(bs)。
  2. 高级变换参数:通常不需要修改这些参数:
  • 变换顺序(Transforms Order):选择读取变换的顺序。
  • 非体块变换(Not a Bulk Transform):在BSpline变换之后的变换没有被设置为BSpline的体块变换。
  • 空间方向不一致(Space Orientation inconsistency):变换和图像之间的空间方向不同(RAS/LPS)。
  1. 刚体/仿射参数
  • 旋转点(Rotation Point):如果围绕一个点进行旋转的话,这个点就很重要,否则不需要。
  • 居中变换(Centered Transform):将变换的中心设置为输入图像的中心。
  • 图像中心(Image Center):用于居中变换的图像(仅在选择了“居中变换”时使用)。
  • 逆ITK变换(Inverse ITK Transformation):在从输出图像应用到输入图像之前反转变换。
  1. 手动输出参数:输出图像的参数:
  • 间距(Spacing):每个维度上的间距(0表示使用输入图像的间距,也就是不改变)。
  • 大小(Size):每个维度上的大小(0表示使用输入大小,也就是不改变)。
  • 原点(Origin):输出图像的原点。
  • 方向矩阵(Direction Matrix):方向矩阵的9个参数(按行排列)。
  1. 高级重采样参数:用于重采样的参数:
  • 线程数(Number Of Thread):用于计算输出图像的线程数。
  • 默认像素值(Default Pixel Value):输入区域之外的样本的默认像素值。
  1. 窗函数同步插值函数参数:用于窗函数同步插值的参数:
  • 窗函数(Window函数:窗函数类型,包括Hamming(h)、Cosine(c)、Welch(w)、Lanczos(l)和Blackman(b)​1​。
  1. B样条插值函数参数:用于B样条插值的参数:
  • 样条阶数(Spline Order)​1​。
  1. 手动变换:仅在没有设置变换节点时使用:
  • 变换矩阵(Transform Matrix):变换矩阵的12个参数(按行排列,最后3个为平移)。
  • 变换(Transform):变换算法,包括刚性变换(rt)和仿射变换(a)。

注意,这个模块实现了通过使用ITK变换来进行图像和向量图像的重采样。重采样是在空间坐标中进行的,而不是像素/网格坐标。因此,确保图像间距在涉及的图像上被正确设置是非常重要的。