骨重建自动分割

软件版本:5.22
问题描述


老师好,想用CT轴位实现髋关节骨性重建,有无自动分割的模块啊?

目前没有针对骨头的全自动分割模块。 Segment Editor :这个模块提供了多种分割工具,包括手动和半自动的方法。其中的"Thresholding"和"Grow from seeds"工具对于骨骼分割尤其有效。"Thresholding"工具允许你根据像素值(在CT图像中,这通常与HU值相关)来分割图像,这对于分割高密度的骨骼特别有用。"Grow from seeds"工具则允许你在图像中种植种子,然后自动分割出与种子相连的相似区域。

可以在Segment Editor模块中选择阈值法进行骨重建后,如内部有很多空洞,可以应用其他工具如光滑工具进行填充操作,也可以应用Wrap Solidify模块进行填充操作。

这个需要自己训练,针对骨骼的自动分割还是比较好训练的,效果也很好,可以参考monai,按教程走,可以在slicer内使用。

请问有什么比较好的模型内部填充软件


是这样的,我在用Thresholding功能模块提取颌骨后发现内部有许多空洞,但我担心导出STL模型用于打印时模型会出现变形或者其他问题,所以我想要一个实体模型,我自己用的是多文件DICOM数据,上面曹玉福老师讲的wrap soildify模块进行填充操作我操作过后软件就卡住冻结了,我自己对于这个模块掌握不是很熟络,但我在教程中没找到相关教程 :pray:

卡住的话,是这个操作比较费时,分割部位越大,需要的时间就越长。然后这里有两个概念,一个是分段,一个是模型,分段是分段编辑模块制作出来的mask,是可以做成实心的。然后分段可以转为模型,叫表面重建。模型仅有表面。
然后阈值分割的时候会因为骨骼内部阈值较低导致分段孔洞出现,就不会变成实心的了。再由这样的分段生成模型,模型内部就会多一层表面数据,而不是仅有最外层表面了。

wrap soildify模块的话,操作也不难,基本上就是选择填充半径大小,选择分段,应用就可以了,你可以将目标数据裁剪的小一点,多试试看看效果。这个填充针对一定的数据,比如股骨中心处孔洞那种封闭的,处理效果还挺好的,但是那种开放型孔洞,效果就不太好了。
填充不好的话,还是手动再修补下比较好。

你可以尝试试用下半自动工具,比如种子生长,这种能够比较好的解决这个问题

感谢您的回复与帮助,我会按照您的思路和方法进行尝试 :pray:

可以参考下:https://slicercn.com/6357/
https://www.youtube.com/watch?v=6Qo7rA2yipg

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好的