segmentation statistics无法计算灰度

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导入外源图像与.vtm外源分割文件后，3Dslicer可以正常识别，但是只能计算出体积计算不出灰度，请问有老师能指点一下吗

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解决方法

在 3D Slicer 里按下面做：

  1. 进入 Segment Editor
  2. 选择你的外源 .vtm 分割
  3. Source volume 选择对应的 MRI/CT 原始灰度图
  4. 点击 Specify geometry
  5. 选择同一幅原始灰度图作为参考几何
  6. 确认后进入 Segmentations 模块
  7. 在 Representations 里创建/更新 Binary labelmap
  8. 回到 Segment Statistics
  9. 勾选 Scalar Volume Statistics
  10. 点击 Apply

简要原因

.vtm 本质上是表面模型/闭合曲面，所以 Slicer 可以根据表面算出：

  • 体积
  • 表面积

但灰度统计需要分割区域和原始图像体素一一对应，也就是必须有 Binary labelmap，并且它的几何信息要和原始图像一致。

所以问题的核心是：

.vtm 可以算体积，但不能直接用于灰度统计；必须先把它转换成与原图匹配的 binary labelmap。

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你问题解决了吗，我也遇到了一样的问题