软件版本:5.6.2
问题描述:如何使用3Dslicer对肺进行流域分段?
3D Slicer使用“Segment Lung Lobes”模块进行肺流域分割教程
在3D Slicer中,Segment Lung Lobes 模块用于进行肺部分叶(流域)分割。这是肺部影像分析中的一个重要步骤,尤其是当分析不同肺叶的解剖结构或病变分布时。以下教程详细说明了如何使用该模块对肺进行分叶处理。
1. 前提条件
在进行肺流域分割前,确保您已经安装了 Chest Imaging Platform 模块,并导入了肺部CT数据。
2. 加载CT影像
- 通过 “加载数据”(Load Data) 导入您的肺部CT扫描(例如DICOM格式)。
- 确保数据正确显示在视图中。
3. 打开Segment Lung Lobes模块
- 在模块列表中,选择 “Chest Imaging Platform” → “Segment Lung Lobes”,进入肺部分叶分割界面。
4. 设置参数
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Input label map file name(输入标签图文件名):选择您已生成的肺部分割标签图。如果尚未生成肺部分割标签,可以先进行肺部阈值分割。
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Output label map file name(输出标签图文件名):设置分叶结果输出的标签图文件名。如果没有,系统会自动生成一个输出文件。
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Left lung lobes shape model file name(左肺叶形状模型文件名) 和 Right lung lobes shape model file name(右肺叶形状模型文件名):这些参数用于定义左右肺叶的形状模型,通常使用系统默认的NA值。
5. Fiducial Points(标记点)
标记点用于定位特定的肺叶解剖位置:
- Horizontal Right Fiducials(右肺水平标记点):选择右肺的水平裂标记点。
- Oblique Right Fiducials(右肺斜裂标记点):选择右肺的斜裂标记点。
- Left Oblique Fiducials(左肺斜裂标记点):选择左肺的斜裂标记点。
使用3D Slicer中的标记工具(Fiducial Tool),可以手动在CT影像中指定这些位置。如果没有手动标记,模块也可能通过算法自动检测。
- RAS/LPS/Index:选择标记点坐标的参考系,通常使用 RAS(右前上)。
6. Fissure Particles(裂隙粒子)
粒子文件定义了肺叶裂隙的解剖学特征:
- Left oblique particles file name(左肺斜裂粒子文件名):设置或保持默认值NA。
- Right oblique particles file name(右肺斜裂粒子文件名):设置或保持默认值NA。
- Right horizontal particles file name(右肺水平粒子文件名):设置或保持默认值NA。
7. Region Type Points(区域类型点)
- Region and type points file(区域和类型点文件名):如果有自定义的区域标记文件,可以在此加载;否则保持NA即可。
8. Options(选项)
- Lambda:该参数用于调整分割的平滑程度,通常保持默认值(如0.1)。
- Right Mean Shape(右肺均值形状) 和 Left Mean Shape(左肺均值形状):可以勾选这些选项来使用均值形状模型进行分割。
9. 运行分割
- 完成设置后,点击右下角的 “Apply”(应用) 按钮,开始运行分割算法。
10. 查看与调整结果
分割完成后,可以在3D视图中检查分割结果:
- 打开 “3D 视图” 以可视化分割结果。
- 如果结果不理想,可以返回 “Segment Editor”(分割编辑器) 使用工具(如“剪刀”或“画笔”)进行修整。
11. 保存分割结果
- 分割完成后,您可以通过 “保存”(Save) 按钮将结果导出为标签图像或3D模型文件。
总结
通过使用 Segment Lung Lobes 模块,您可以在3D Slicer中快速且精确地完成肺部分叶分割。该模块允许用户根据肺叶的解剖学特征进行手动调整,并提供了自动分割工具进行肺部不同叶片的精细划分。
收到,谢谢曹老师