新手小白,请教老师怎样勾画海马MR的感兴趣区,包括颞叶宽度、海马沟回间距、海马与脑干间距及海马高度等
在 3D Slicer 中勾画海马及相关解剖结构的感兴趣区(ROI),需要使用特定的工具和模块,结合 MRI 数据来定义区域并测量解剖参数。以下是详细步骤:
1. 导入 MRI 图像
- 加载图像:在 3D Slicer 中打开 MRI 数据,通常以 DICOM 格式加载。
- 调整窗口/层级:在
Volumes
模块中优化图像对比度,使海马结构更清晰。
2. 勾画感兴趣区 (ROI)
使用 Segment Editor 模块,手动或半自动地勾画海马及相关结构的 ROI。
- 添加新分割:在
Segment Editor
中创建一个新分割,命名为 “海马”。 - 选择工具:使用 “Paint” 、 “Draw”、 “Level tracing”等工具进行手动勾画,或使用 “Threshold” 工具设置强度阈值进行半自动勾画。
- 使用“岛屿”工具:将不必要的部分去除,确保只留下海马结构。
3. 测量解剖参数
3.1 颞叶宽度
- 在轴状切片中测量:切换到轴状视图,定位到颞叶最宽处。
- 使用 Ruler 工具:在
Markups
模块中使用 Ruler 工具测量左右颞叶的宽度。
3.2 海马沟回间距
- 在冠状切片中测量:在冠状视图中观察并定位到沟回区域。
- 添加标记点:在
Markups
中添加 Fiducial 标记,测量海马与其周围脑回之间的距离。
3.3 海马与脑干间距
- 在冠状切片中测量:在冠状或轴状视图中,找到海马和脑干之间的最短路径。
- 使用 Ruler 工具:在 Markups 中使用 Ruler 工具测量海马与脑干的最小距离。
3.4 海马高度
- 在矢状切片中测量:切换到矢状视图,找到海马的最高和最低位置。
- 使用 Ruler 工具:使用 Ruler 工具垂直测量海马高度。
4. 保存和导出测量结果
在完成各项测量后,可以在 Markups
模块中导出测量结果,或使用 Python 控制台保存所有测量数据。
通过这些步骤,您可以在 3D Slicer 中有效地勾画和测量海马的感兴趣区域及其相关解剖参数。