软件版本:我用DSI Studio重建神经纤维素,点击“Enable autotrack”怎么出现“no tractography atlas associated with the current template”,是软件问题还是哪个设置问题?请大神指点一二。
问题描述:
软件版本:我用DSI Studio重建神经纤维素,点击“Enable autotrack”怎么出现“no tractography atlas associated with the current template”,是软件问题还是哪个设置问题?请大神指点一二。
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哈哈,问题已经解决了.
你好方便问问是怎么解决的吗,我也遇到了这个问题
出现“no tractography atlas associated with the current template”错误的主要原因是 当前使用的模板未正确关联到DSI Studio内置的纤维束图谱(tractography atlas) ,属于设置问题而非软件本身故障。以下是详细分析和解决方案:
AutoTrack的依赖条件
DSI Studio的AutoTrack功能需要基于预定义的纤维束图谱(如HCP842或ICBM-152图谱)进行纤维追踪。该功能通过将个体数据非线性配准到标准MNI空间,并与图谱中的流线进行Hausdorff距离匹配来识别目标纤维束。若当前模板未关联到这些图谱,则会触发此错误。
图谱文件缺失或未加载
\atlas\icbm152
文件夹中内置了icbm152.tt .gz
图谱文件。若安装时未正确配置或文件丢失,会导致无法加载图谱。数据重建步骤未完成
AutoTrack需要先通过QSDR(Q-Space Diffeomorphic Reconstruction)将数据重建到MNI空间,生成.fib.gz
文件。若跳过此步骤或重建失败,模板与图谱的配准会失效。
确认内置图谱路径:
在DSI Studio安装目录的\atlas\icbm152
下查找icbm152.tt .gz
。若缺失,需重新安装软件或从官网下载补充文件。
(Mac用户需右键点击dsi_studio.app
选择“显示包内容”以访问该路径)
手动加载图谱:
在纤维追踪窗口(Step T3),通过[Tract][Open Tracts]
加载图谱文件,例如icbm152.tt .gz
或从HCP项目下载的其他兼容图谱。
.fib.gz
文件。.fib.gz
文件是否包含MNI space
标签。若未成功配准,需重新调整重建参数(如各向异性分辨率、b值等)。HCP1065.1mm.fib.gz
等兼容模板,替换当前模板。[Tracts][Save All Tracts As…]
将手动追踪的纤维束保存为新图谱,后续加载此文件。此错误通常由模板与纤维束图谱未正确关联引起。解决步骤包括:(1) 加载内置或兼容的图谱文件;(2) 通过QSDR确保数据重建到MNI空间;(3) 验证数据质量与参数设置。若问题持续,建议参考和的详细流程排查数据预处理步骤。