先在 Segment Editor 中保证主动脉腔道连续、剪掉多余分支、轻度扩张后平滑,然后在腔内放置近端/远端端点,用 Extract centerline 得到可靠中心线,再用 Vessel cross-section analysis 沿中心线自动计算各位置截面,从缩窄最重处或指定位置读取直径即可。
1. Segment editor 平滑后中心线不能从起始端点开始的处理
原因一般是:血管腔在近端被剪得过短/过细、平滑后局部闭合,或端点标在血管壁上,VMTK 找不到从该点出发的连通路径。
处理步骤:
-
在 Segment Editor 中只保留主动脉腔:
-
阈值 + Islands 保留最大连通块;
-
Scissors 去掉头臂干、颈总、锁骨下等不需要的分支,只保留主动脉主干。
-
-
为避免平滑“磨没”狭窄段:
-
先用 Margin(膨胀)扩张 1–2 voxel;
-
再用 Smoothing(推荐 Joint smoothing,强度中等)整体平滑;
-
滚动切片确认从近端到远端腔道完全连通、没有“卡断点”。
-
-
新建一个 Markups Fiducial 列表(如
Centerline endpoints):-
端点一定放在“腔内”,不要放在壁上;
-
近端点放在狭窄前 1–2 cm,远端点放在狭窄后 1–2 cm。
-
-
在 Extract centerline 模块:
-
Surface 选刚才的 segment;
-
Endpoints 选刚才的 fiducial 列表;
-
勾选 “Preprocess input surface”,必要时勾上 “Use only largest tree”;
-
Apply。若起点仍往下游偏,再回 Segment Editor 把狭窄处稍微扩张一点后重算。
-
2. 主动脉缩窄病变处如何量“需要位置”的直径
有了稳定的中心线后,用 VMTK 的截面分析模块就能定量出各位置直径。
推荐流程:
-
打开 Vessel cross-section analysis(SlicerVMTK):
-
Input surface:选主动脉模型/segment;
-
Input centerline:选刚刚得到的 centerline curve。
-
-
Apply:
- 模块会沿中心线自动计算每个位置的截面信息(面积、等效直径等),并生成表格。
-
在 3D 视图或表格中:
-
把截面滑动到肉眼判断最狭窄处,读取该位置的 “Equivalent diameter”(或最小直径);
-
若需要特定距离处的直径,可在中心线上加一个 fiducial 点,或按曲线长度定位后再读对应截面。
-
