十堰市人民医院神经外科
3DSlicer社区微信公众号中有文章介绍过应用3DSlicer对畸变图像进行校准的方法。我个人常用另一种更直观的方法进行校准,应用到国产软件 医三维 和国外的一个影像处理软件 Mango 。
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CT扫描时为了获得标准的OM基线时,技师会通过调整扫描机架与扫描床的角度来完成。
相关倾斜角度信息可以在CT胶片中进行查看,如下图CT图像所示倾斜度为-12.0。
将这样的数据直接导入3D Slicer软件中,会产生图像畸变。
1、启动 医三维 软件 :选中相应数据文件夹并导入影像数据,在软件界面下栏中鼠标右键点击图标,选择MPR重建并在新标签中打开。
2、标准OM基线调整 :通过调节弧形箭头简单几步即可完成。
3、切片重组 :如下图选中右上角绿色图标,在弹出对话框中对序列描述进行重命名,方便记忆但不能为中文。步长(mm)为层距,Slicer count为Slicer数量,为系统自动生成,不需更改。
4、数据储存 :转换后的数据文件储存的默认目录在C盘用户文件夹里,可以在软件设置中对工作空间路径进行更改。
5、数据导入 :将数据导入到3D Slicer中,发现畸变并没有得到校准。
6、 数据转换 :应用国外的影像处理软件Mango对数据进行转换后才能用于3D Slicer,将文件导入到Mango中,另存为nii.gz(压缩格式)或者nii格式。
7、数据导入到3DSlicer :将Mango转换后的nii格式文件导入到3D Slicer中,发现畸变已经得到校准。
应用医三维和Mango这两个小软件可以方便直观的调整OM线和校准畸变。软件小巧、占用系统资源少、运行流畅,医三维软件还有体重建、数据测量、一键去除背板、一键去除颅骨等功能,值得一试。