Allen脑图谱模型重建配准

软件版本:4.10.2
问题描述
我想利用Allen CCF的数据构建一个小鼠脑的三维模型,我选取了其中的部分文件,如图1,annotation_100.nrrd相当于全脑的模板,我将它作为volume导入。另外两个文件夹里面的文件代表每个脑区,我选取了对应的几个脑区的数据将它们分别作为segmentation和model导入,对于structure_centers.csv,这个文件表示每个脑区的相对坐标,我不知道怎么利用这个文件的信息在3D slicer中配准。之前的尝试中我将这个文件作为table导入,发现并不能自动配准,并且segmentation与volume距离相差很大,无法通过微调来配准。希望大家提供一些线索或者建议,谢谢!

—附数据集来源: http://download.alleninstitute.org/informatics-archive/current-release/mouse_ccf/annotation/ccf_2017/

图1:image