MRI图像显示不清楚、显示不全问题？

问题求助
1

为什么只有横断面图像清楚，矢状面和冠状面图像不清晰？

20180419205436
201804192054361101×796 254 KB

为什么图片只显示一窄条？

20180419205413
201804192054131134×873 208 KB

2

导入的数据只有横断位（水平位、轴位）的图像，矢状位和冠状位图像都是由3DSlicer软件重建出来的，清晰度取决于横断位图像的层距，层距越小，重建之后的图像越清晰，一般情况下1mm的扫描图像就显示很清晰了。看截图所示应该层距为5mm左右。

与第一幅截图不同的是，这个扫描的数据只有矢状位图像，而横断位图像和冠状位图像是由软件重建出来的，当扫描层距为5mm左右时，重建之后不是太清晰，当扫描垂体时往往不必扫全整个头颅，只扫了垂体为中心的一部分。

5

曹老师您好，关于这个帖子我也遇到了一样的问题，矢状位和冠状位均不清晰（我的目的是为了计算脑体积），但是也搜索了很多地方，无法找到重建层距的地方，希望您指导一下，望回复，非常感谢！

6

如果您的原始数据层厚很厚（比如 Z 轴分辨率低），通过将数据重采样为 各向同性（比如 1mm × 1mm × 1mm），虽然不能让图像看起来更清晰（仍然是模糊的），但对于计算体积和**3D建模（Segment Editor）**非常重要，可以避免产生阶梯状的模型。

在 3DSlicer 中，Crop Volume（体素裁剪） 模块不仅仅用于“裁剪”图像大小，它还有一个非常重要的功能：重采样 (Resampling) / 各向同性 (Isotropy)。

如果您也遇到了类似问题，请按照以下步骤使用 Crop Volume 模块进行处理：

  1. 打开模块：

    • 在模块下拉菜单中搜索并选择 Crop Volume。

  2. 设置输入输出：

    • Input Volume: 选择您那个“模糊”的原始影像。

    • Output Volume: 选择 Create new Volume as...（新建一个卷），建议重命名为 “Resampled_Volume” 以示区别。

  3. 调整 ROI (感兴趣区域)：

    • 点击 Fit to Volume 按钮，让黄色的裁剪框包裹住整个影像（或者只包裹住您要计算体积的脑部区域）。

  4. 关键步骤：设置间距 (Spacing) —— 这就是“重建层距”：

    • 找到 Spacing scale 或 Interpolated cropping 区域。

    • 勾选 Isotropic spacing (各向同性间距)。

    • 或者手动将 Spacing 的数值（P, I, S）全部改为 1.00 mm（或其他您需要的精度）。

    • 注意：此时您会看到 Estimated memory size（预估内存）会变大，这是正常的。

  5. 执行：

    • 点击 Crop 按钮。

结果说明

  • 视觉上： 新生成的 Volume 在矢状位和冠状位看起来可能仍然是“糊”的（因为扫描层厚问题），但是像素点变密了，变得更加平滑。

  • 功能上： 在使用 Segment Editor 进行脑组织分割时，工具（如 Threshold 或 Paint）会更加跟手，计算出的体积数据也会因为体素规整而稍微准确一些。