012-随意剪切

3DSlicer定位零基础12-随意剪切

作者 :曹玉福

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脑出血定位贴定位零基础 12

3DSlicer数据成功导入,通过Volume Rendering模块使颅脑三维显示,并可以通过ROI对体绘制的六个面进行裁剪。但是背板总是影响观看的效果,通过Editor模块可以方便的去掉背板,具体教程可以参考本公众号3DSlicer社区(SlicerCN),今天要介绍如何通过Segment Editor中的剪刀等工具对背板进行随意剪切去除。

一、颅脑渲染

在Volume Rendering模块中对导入的CT数据进行渲染,如下图所示,背板影响观看效果。

二、模块安装:

需要安装两个模块才能完成今日的教程。

1、Informatics分类中的MarkupsToModel

2、Segmentation分类中的SegmentEditorExtraEffects

如果因网络原因不能下载这两个模块,可以访问3DSlicer中文论坛进行下载:https://forum.slicercn.com/t/topic/1792。

安装成功后可以在Segment Editor模块中见到Mask Volume工具。

二、新建蒙版

类似于画图软件中的蒙版操作,进入到Segment Editor模块,通过点击Add对蒙版进行添加,选中并点击Remove对蒙版进行删除。还可以对颜色及名称进行修改。

三、剪刀工具

选取Scissors(剪刀)工具后,下面的选项选择Fill inside(填充里面)和Free-form(自由形状),其他选项的含义在后面章节进行介绍。新版本可在操作中关闭Surface smoothing(表面平滑)后,处理速度明显加快。

四、Volume剪切

以往对Volume剪切可以通过Crop Volume,Volume clip with model及Volume clip with ROI,略显繁琐。今天介绍的方法用到Mask volume工具,通过在Scissors(剪刀)和Mask volume间进行切换从而达到Volume剪切的目的。很多小伙伴不知道的是, 切换支持空格键!!!

四、数据保存

剪切之后的Volume数据通过Save菜单进行保存。

学习过程中如有问题可在论坛发帖提问,论坛需要填写真实邮箱才能成功注册。3DSlicer交流三群及脑卒中与神经重症群尚有少许名额,拟入群交流的加曹玉福微信(微信号:caoyufu),注明姓名、医院、专业,经过验证后可入群交流,发广告人员勿扰,否则在群里公布并设置为黑名单。

文章列表:

曹老师,Mask中的Fill value有什么含义呢?什么情况下选择-1000?

去除部分以什么灰度值填充,选择-1000时以空气灰度值填充,这样在Volume Rendering显示的时候,去除部分不显影不会影响到Volume的3D显示。