体数据模型剪切Volume clip with Model（Wiki）

经验分享
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image Volume Clip With Model（Wiki）

  • Volume clip with model（体数据模型剪切法）

    Removes volume contents inside or outside the selected surface model

    移除选定曲面模型内部或外部的体数据内容

    User may define and dynamically edit a 3D clipping surface by markup points (uses Delaunay triangulation, therefore it mostly generates convex surfaces)

    用户可以通过标记点定义和动态编辑3D裁剪表面（使用Delaunay三角剖分算法，因此它主要生成凸曲面）

    For incremental clipping select the input volume also as output volume

    对于增量裁剪，请将输入体数据也作为输出体数据

Clip irrelevant image areas of the input volume before segmentation

分割前剪切输入体数据的无关图像区域

  • Go to Volume clip with model module （进入体数据模型剪切模块）

  • Set（设置）:

    Input volume: your input image

    输入体数据： 你要输入的图像

    Clipping surface: Create new model

    剪切表面：创建新的模型

    Clipping surface from markups: Create new MarkupsFiducial

    以标记点剪切表面：创建新的标记基准点

    Clip outside: uncheck

    剪切外面区域：取消选中

    Fill value: background voxel value (depending on your imaging modality it may be -1000, 0, or other)

    填充体素值：背景体素值（取决于你的成像模式，它可以是-1000,0，或其他）

    Output volume: Create new volume

    输出体数据：创建新的体数据

    Drop/move a few markup fiducials around the image areas that you would like to remove

    在将要删除的图像区域周围放置/移动一些标记基准点

    Click apply

    点击应用

  • If there are more areas to remove then set the created Volume node as Output volume and repeat the following steps

  • 如果有更多区域要移除，请将创建的体数据节点设置为输出体数据，然后重复以下步骤

    Set: Clipping surface from markups: Create new MarkupsFiducial (or go to the Markups module to remove all fiducials from the current list)

    设置：以标记点剪切表面：创建新的标记基准点（或去Markups模块从当前列表中删除所有的基准点）

    Drop/move a few markup fiducials around the image areas that you would like to remove

    在要删除的图像区域周围放置/移动一些标记基准点

    Click apply

    点击应用

Create quick mask for registration

为配准创建快速蒙版

  • Go to Volume clip with model module （进入体数据模型剪切模块）

  • Set（设置）:

    Input volume: your input image

    输入体数据： 你输入的图像

    Clipping surface: Create new model

    剪切表面：创建新的模型

    Clipping surface from markups: Create new MarkupsFiducial

    以标记点剪切表面：创建新的标记基准点

    Output volume: Create new volume

    输出体数据：创建新的体数据

    Drop/move a few markup fiducials around your region of interest on 2-3 orthogonal slices (3-4 fiducials on each slice should be enough)

    在2-3个相互垂直的切片上的感兴趣区域周围放置或移动一些标记基准点（每个切片上放置3-4个基准点应该足够了）

    Click apply

    点击应用

  • Set（设置）:

    Input volume: Volume (the mask volume that you created)

    输入体数据：体数据（您创建的蒙版体数据）

    Clip outside: uncheck

    剪切外面区域：取消选中

    Fill value: 100

    填充体素值：100

    Click apply

    点击应用

具体应用案例参见：天天练040-体数据模型剪切（Volume clip with Model）