使用swiss skull stripper模块剥离颅骨后重建血管在血管畸形诊治中的运用

西安交通大学第一附属医院神经外科 杜昌旺

安装及使用swiss skull stripper见济南军区总医院神经外科王奎重教授的教程贴 利用3D Slicer自动剥离CT或MRI影像上的头皮和颅骨

我在操作过程中强调一下可能出现的问题。


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从官网上下载的这两个文件:atlas image、atlas brain mask,把它们保存在无中文名字的文件夹内待用,

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并修改文件名分别为Atlas.mha(不修改或修改任意文件名Patient Out Volume可以识别)和AtlasMask-label. mha(这个文件必须修改为AtlasMask-label. mha,否则Patient Mask Label选项不能识别这个文件 )。

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修改文件名后重新载入,看是不是能识别了,这个是关键。

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进入Swiss Skull Stripper模块,选择病人的影像系列。

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选择输出患者的Volume及Mask Label名称,选择默认即可,但是最好能做标记,不然处理多了,你自己也不知道三维建模的时候用哪个系列

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选择Atlas中刚下载更名的文件,注意不能选择错了,Atlas Volume要选Atlas,Atlas MaskVolume要选择AtlasMask-label,然后点Apply。

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运行完了后得到如下结果

然后点击每个位像框的左上角的图钉,弹出框里点击>>,最后点击眼睛图标使其闭上,显示的就是去除头皮和颅骨的CTA像(名称为Patient Output Volume)。

噢,天啦,咋是黑黑的图像,不像MRI剥离头皮颅骨教程里教的哪样?这也是我刚开始很久没有想明白的地方。

嘿嘿,最后弄明白了,调节窗宽窗位试试。

然后重建血管影!我是用segment edit编辑的。下图为术前的血管畸形的三维重建。

手术方式为开颅动静脉畸形切除术,下图为术后一年复查的CTA重建。

欢迎大家交流,微信号:dcw0922

在4.11版本中软件已经更新,对MRI数据无需Atlas Volume和Atlas Mask Volume两个文件即可自动进行剥离,但这两个文件对CTA和CT数据的支持不好。可以通过自己制作文件解决。

2、应用3DSlicer实现颅骨自动剥离

1、利用Swiss Skull Stripper对CT和CTA进行颅骨自动剥离的方法


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为什么我的无法识别!!1527311927(1)

你要载入才行,或者文件放在中文文件夹里了

链接:https://pan.baidu.com/s/1sixpFmJapryiK8p5DrAR0A
提取码:3jrk

我想问下,载入的数据是什么类型的?

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为什么我点击“Apply”显示有误?image

请教,我下了这两个文件,文件名已修改,路径名无中文,仍在SWISS中找不到,这两个文件要放在那个文件下?

要载入到3DSlicer中,拖入3DSlicer界面即可。

在MRA上使用SWISS工具,虽然成功剥离了脑组织,但脑血管部分缺失较重,通过MASK、Segmengtion的import、Add等不同工具的联合运用,重塑血管,成功将血管“粘合”上了,而且“粘合”的血管与建模的脑组织内的血管,竟完全重叠。自己感觉软件功能强大,自己要不断的尝试,会对一些工具的功能进一步熟悉,还会有一些意外收获。 :grinning: :grinning:

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