使用swiss skull stripper模块剥离颅骨后重建血管在血管畸形诊治中的运用

[dcw922]

西安交通大学第一附属医院神经外科 杜昌旺

安装及使用swiss skull stripper见济南军区总医院神经外科王奎重教授的教程贴 利用3D Slicer自动剥离CT或MRI影像上的头皮和颅骨

我在操作过程中强调一下可能出现的问题。

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从官网上下载的这两个文件：atlas image、atlas brain mask，把它们保存在无中文名字的文件夹内待用，

并修改文件名分别为Atlas.mha（不修改或修改任意文件名Patient Out Volume可以识别）和AtlasMask-label. mha（这个文件必须修改为AtlasMask-label. mha，否则Patient Mask Label选项不能识别这个文件 ）。

修改文件名后重新载入，看是不是能识别了，这个是关键。

进入Swiss Skull Stripper模块，选择病人的影像系列。

选择输出患者的Volume及Mask Label名称，选择默认即可，但是最好能做标记，不然处理多了，你自己也不知道三维建模的时候用哪个系列

选择Atlas中刚下载更名的文件，注意不能选择错了，Atlas Volume要选Atlas，Atlas MaskVolume要选择AtlasMask-label，然后点Apply。

运行完了后得到如下结果

然后点击每个位像框的左上角的图钉，弹出框里点击>>，最后点击眼睛图标使其闭上，显示的就是去除头皮和颅骨的CTA像（名称为Patient Output Volume）。

噢，天啦，咋是黑黑的图像，不像MRI剥离头皮颅骨教程里教的哪样？这也是我刚开始很久没有想明白的地方。

嘿嘿，最后弄明白了，调节窗宽窗位试试。

然后重建血管影！我是用segment edit编辑的。下图为术前的血管畸形的三维重建。

手术方式为开颅动静脉畸形切除术，下图为术后一年复查的CTA重建。

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[Caoyufu (曹玉福)]

在4.11版本中软件已经更新，对MRI数据无需Atlas Volume和Atlas Mask Volume两个文件即可自动进行剥离，但这两个文件对CTA和CT数据的支持不好。可以通过自己制作文件解决。

2、应用3DSlicer实现颅骨自动剥离

1、利用Swiss Skull Stripper对CT和CTA进行颅骨自动剥离的方法

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[rootion]

为什么我的无法识别！！

[dcw922]

你要载入才行，或者文件放在中文文件夹里了

[Shu]

链接：https://pan.baidu.com/s/1sixpFmJapryiK8p5DrAR0A
提取码：3jrk

[Mr.He]

我想问下，载入的数据是什么类型的？

[Mr.He]

为什么我点击“Apply”显示有误？

[剑客]

请教，我下了这两个文件，文件名已修改，路径名无中文，仍在SWISS中找不到，这两个文件要放在那个文件下？

[Caoyufu (曹玉福)]

@剑客

这两个文件要放在那个文件下？

要载入到3DSlicer中，拖入3DSlicer界面即可。

[剑客]

在MRA上使用SWISS工具，虽然成功剥离了脑组织，但脑血管部分缺失较重，通过MASK、Segmengtion的import、Add等不同工具的联合运用，重塑血管，成功将血管“粘合”上了，而且“粘合”的血管与建模的脑组织内的血管，竟完全重叠。自己感觉软件功能强大，自己要不断的尝试，会对一些工具的功能进一步熟悉，还会有一些意外收获。