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问题描述:
3D slicer用editor软件分割病灶或者肿瘤生成的ROI文件,怎么转换成CSV的矩阵数据,也就是相当于CSV里面包含着勾画区域的坐标信息
1、将ROI文件转换为Segmention,在Data模块界面中右键点击即可转换。
2、Radiomics模块特征提取即可输出Table。
曹老师 我的意思不是用于提取特征;只是单纯的想把分割的区域,也就是生成的segmentation文件(nrd)格式转换成 csv格式,
这样我们方便用Matlab基于这个分割的ROI进行后续计算
曹老师 我的意思不是用于提取特征;只是单纯的想把分割的区域,也就是生成的segmentation文件(nrd)格式转换成 csv格式,
通过这个CSV格式的数据(应该是一个带有空间信息的矩阵),方便后续进行Matlab进行分析和后处理
曹老师,我不提取组学特征,只是想得到分割的数据,不以图像nrd格式的形式,而是以CSV的格式
找找 parenchyma analysis module
请问您的问题解决了吗= =,我也是想把segment editor处理后图像从nrrd输出为nii格式
无法做到直接输出为nii格式,不过可以先将Segment转换成label格式,之后再将label格式保存为nii格式。
谢谢曹老师= =