关于Elastix配准问题

老师您好,我在使用Elastix配准的过程中,按照默认设置,配置完成以后,新的CT图像被自动裁剪了一部分,举个例子,我拿CT 去匹配MR,MR只是半个脑袋的扫描,CT是全脑扫描,那配准后新生成的CT也只是半个脑袋的,请教这个问题怎么解决?能不能给个详细步骤,非常感谢!另外,我用MR去配准CT是不成功的。

使用标记点配准

怎么插入标记点?