从医生工作站获取影像资料用于3DSlicer重建

山西省晋中市榆次区人民医院神经外科 布鑫

自去年加入3DSlicer中国社区微信群后,学到了很多知识,对自己的工作有很大的帮助。患者Dicom格式影像数据的获得主要依靠PACS系统和CT工作站光盘刻录。我们单位使用的是华海临床医师工作站,只提供浏览和简单的测量等交互功能,远远不能满足临床的需求,无法获取DICOM格式文件时,也就无法应用3DSlicer实现重建、定位、增强现实等操作。经过一段时间的摸索,现总结出可以导出影像文件的方法,因没有验证,不知在其他PACS系统上是否可行。

我们浏览患者影像数据的时候,医生影像工作站会自动下载影像文件到C盘根目录中的temp文件夹中,文件后缀命名为“.tmp”格式,其实它是完整的图像文件,只是更改了后缀而已。

1、打开华海临床医生工作站,找到患者的影像资料图,记下患者相关信息:① 检查日期;② 影像号;③ 图片数量。

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2、浏览后的图片被自动下载到电脑的temp目录里(一般在C盘的根目录下,如C盘根目录下没有可咨询PACS系统工程师);

3、打开temp文件夹,发现文件夹是按照检查日期自动命名;

4、打开相应检查日期的文件夹,发现不同患者的数据存放在以影像号命名的文件夹中。按照记录的影像号查找相应的文件夹并打开,可以看到数量相符的一组tmp文件;

5、将找到的文件通过U盘复制到运行3DSlicer的电脑里,用Mango软件读取并转换成nii.gz文件;

6、将nii.gz文件导入3DSlicer内进行后期三维重建等处理。

对于像CTA这类检查,一般影像科不上传原始数据,只上传处理后的数据,可联系影像科医师上传至工作站。部分单位运行PACS系统的电脑USB接口不开放,就无法用到这种方法。

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医众软件就不提供Dicom格式文件下载,只能逐一下载JPG或Png格式的文件,图片用于重建的方法可以参考文章:CT图片三维重建方法之3DSlicer篇

如USB接口不开放的情况下,大家可以将影像数据从C盘导入到硬盘的其他分区(D、E、F等)。之后制作启动U盘,应用大白菜或老毛桃工具,从U盘启动后再将数据导入到U盘中即可。感谢丁茂华龚瑾王双志共享心得。

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DTI数据要去工作站刻盘,从PACS导出来的数据没有弥散方向数据而无法用于重建。

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感谢分享。下次在单位电脑上试试看