004-数据获取

3DSlicer定位零基础04-数据获取

作者 :曹玉福

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脑出血定位贴定位零基础 04

3DSlicer应用的数据主要从CT、MRI、PACS系统取得,数据格式为DICOM,部分医院的PACS系统只提供PNG格式的图像数据。因DICOM数据不仅包含图像信息,而且包含姓名、年龄、检查时间、机器参数、空间位置等信息,而PNG格式图像是不包括这些信息的。虽说3DSlicer也能处理PNG格式,但因缺少必要的信息,需要手动输入层距等数据,而且图像质量欠佳。今天介绍如何取得用于图像处理的DICOM数据。

一、光盘刻录

从CT或MRI工作站刻盘,因会延误到技师的操作时间,遇到患者量大的时候往往不能及时刻盘。而刻录光盘要收取工本费,物价部门的定价非常低,一旦刻录机损坏,可不是几百块能解决问题的,希望医生和技师相互理解,良好沟通。

二、U盘导出

几乎所有的工作站都会限制USB口,只有工程师才有权限打开,原因很简单,一旦U盘染毒,会导致数百万的工作站瘫痪。如果USB口恰巧没有限制使用,而我们又有一个新买的U盘,那也可以试一试,至少每次使用前需要重新格式化一次,而且必须是在安装有杀毒软件的电脑上进行格式化。需要说明的是,即使格式化后的U盘,也可能会带有病毒的。

三、PACS系统导出

绝大多数医院是都有PACS系统,应用PACS系统可以非常容易的导出数据。因每个厂家的PACS系统不同,导出数据的方法也不一样。

1、医众工作站:

医众工作站是将患者的数据上传到云端的,在医众工作站里面即可检索到需要的数据,查看患者数据的时候,可以通过设置自动将DICOM数据下载到本地,打开下载文件夹直接可以进行应用。

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2、华海临床医生工作站

打开华海临床医生工作站,找到患者的影像资料图,记下患者相关信息:① 检查日期;② 影像号;③ 图片数量。浏览后的图片被自动下载到电脑的temp目录里(一般在C盘的根目录下,如C盘根目录下没有可咨询PACS系统工程师),打开temp文件夹,发现文件夹是按照检查日期自动命名,打开相应检查日期的文件夹,发现不同患者的数据存放在以影像号命名的文件夹中。按照记录的影像号查找相应的文件夹并打开,可以看到数量相符的一组tmp文件,将找到的文件通过U盘复制导出即可。

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山西省晋中市榆次区人民医院神经外科 布鑫 提供

3DSlicer中文论坛原贴:

四、在线获取

需要获知Storage AETitle和Storage Port参数。

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五、示例数据

在3DSlicer的Sample Data模块中进行下载,默认保存路径为:

C:/Users/Administrator/AppData/Local/Temp/Slicer/RemoteIO/

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下载文件名称列表

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如出现下载困难的情况下,可以在3DSlicer中文论坛打包下载示例文件后,解压缩到默认路径中,论坛文件下载地址:

六、3DSlicer中文论坛数据

3DSlicer中文论坛上传一些用于练习的数据,下载地址:

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学习过程中如有问题可在论坛发帖提问,论坛需要填写真实邮箱才能成功注册。3DSlicer交流三群尚有少许名额,拟入群交流的加曹玉福微信(微信号:caoyufu),注明姓名、医院、专业,经过验证后可入群交流,发广告人员勿扰,否则在群里公布并设置为黑名单。

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