天天练017-体数据感兴趣区剪切法(Volume clip with ROI)

一、学习素材: Slicercn001

二、学习目标:熟悉模块Volume clip with ROI的用法

image Volume clip with ROI(Wiki)


  • Volume clip with ROI box

    • Removes volume contents inside or outside the selected region of interest box
    • For incremental clipping select the input volume also as output volume

  • 体数据感兴趣区剪切法

    • 删除所选感兴趣区域内部或外部的体数据内容
    • 对于增量裁剪,请将输入体数据也作为输出体数据

  1. 模块介绍

    This extension contains modules for clipping image volumes with arbitrary surfaces or region of interest boxes.

    :pushpin: 此扩展包含用于剪切体素图任意曲面和感兴趣区域框2个模块。

    • Volume clip with ROI:可以看做 image 模块的简化版。

    • Volume clip with model:配合image基准点工具做曲面剪切。

  2. 模块安装:需要在扩展模块管理器 image 中进行安装。

    imageimage

  3. 参数设置

    sshot-395

    Input volume:输入体数据

    Clipping ROI:剪切ROI

    Clip outside

    • image 剪切ROI框外面部分,需要勾选。

    • f85024dccd02edf54faafefc304374be77ebf548 剪切ROI框里面部分,去掉对勾。

    Fill value:填充灰度值,CT填 -1000,MRI填 0 。

    Output Volume:输出体数据


CT背板的去除之Volume clip with ROI模块的用法


三、思考题:

  1. 在切片视窗中调节ROI框时如何避免误调窗宽窗位?

  2. Fill value所填写的数值代表的意义是什么?以3图参数设置为例进行说明。

  3. 如何剪切之后只保留血肿部分? 这样会明显加快血肿建模运算速度且使建模变得更便捷 :+1:


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volume中锁定窗宽和窗位?

第二个思考题没找到理想答案。
首先是volume rendering应该用哪一个预设?其次是在volume clip with ROI点击apply后,切片视图就变成一团黑了,不知是否正确?
能否给出一个标准操作流程?

1 个赞

少了一个步骤,应用apply之后,切片视图中还需要重新选择一下体数据。部分答案延迟公布是为了大家积极互动参与,而不是照着流程做一遍,自己不思考,缺少思考即使学习了也很难在临床上有所创新。

image

谢谢曹主任的提示,找到办法了!

只不过试了不同的预设并调节了预设下的shift,始终没能找到示例中那么漂亮的血肿结果。


这个界面怎么调不出来
是不是我安装 VOLUMECLIP没安装对?

安装不了,是因为我装的不是稳定版?


一直就是这个界面,按了install没用

所有版本均可以安装,安装在菜单栏Install Extensions进行,在Manage Extensions进行已经安装的模块的管理,比如卸载,禁用等等。

@Nsurgeon 安装后找不到的模块可以点击Modules右侧的搜索图标,输入模块搜索即可找到。

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