tjlc123
(天剑凌尘)
1
软件版本:VGstudio 1.2.1,Mimics 20.0
问题描述:各位老师好,请教一个问题,我现在一直用mimics进行重建,现在想改用3D slicer试试,因为之前用mimics的时候输入的都是tif格式的,用VGstudio把RAW转换成tif,现在有没有什么方法可以把RAW转换成nii。我的数据是一个文件夹,里面有2048个raw文件,之前用mongo试了一下,可以输入单个的RAW文件,但是不能输入整个文件夹。
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Caoyufu
(曹玉福)
2
可以把数据发我试试:444703546@qq.com
tjlc123
(天剑凌尘)
3
曹老师,我已经把数据发给您了,我目前可以用imageJ把从VGstudio导出来的TIFF格式文件再导出成一个TIFF的stack,昨天试了一下,这个stack可以在3D slicer里面重建。顺便再问您一个问题,我的数据很大,大概有3-4个G,在重建过程中会非常卡,尤其是在island和show 3d过程中,有时候软件会强行关闭,有没有什么方法解决这个问题?
Caoyufu
(曹玉福)
4
数据收到,没有转换成功,方便的话请将转换过程在论坛发一下,截图结合文字说明。
你提到的问题:数据太大导致的软件自动退出,电脑硬件升级可能会解决。也可以尝试缩减数据,将数据分割后处理,之后再合并。
tjlc123
(天剑凌尘)
5
曹老师,我稍后会在论坛上发一份我用VGstudio和imageJ导入数据和导出数据的过程。再请教您一下,因为我是做动物头骨的虚拟三维解剖,所以数据量大,那个3-4G的文件是一个麋鹿鹿角的ct文件,并且已经切割到最小,从16bit转换到8bit,原本16G的文件转换到3-4G目前已经没有办法再缩小文件的体积了,而且我的电脑是thinkpad p53工作站,显卡是专业显卡Nvida Quadro T2000,内存32G,CPU是i7第九代,我觉得电脑的配置应该已经足够了,这种情况下有没有办法解决卡顿问题?
Caoyufu
(曹玉福)
6
硬件配置很高了
我的意思是对完整数据进行切割,分成几个部分再处理,而不是缩减整个数据的体积大小。
如下图,在Segment Editor模块中应用Split Volume将整个数据进行分割。
处理完成之后如果想得到Volume数据则应用Add Scalar Volumes模块进行合并。
如果想取得整个蒙版数据,则在Logical operators中进行add操作。
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剑客
(剑客)
8
曹主任,求教Segment Editor模块中应用Split Volume进行分割的方法?我试了多次,不明白使用方法。