天天练051-ACPC Transform模块调整中线

一、学习素材: Slicercn002

二、学习目标:熟悉ACPC转换模块的用法


ACPC Transform(ACPC转换)

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  • ACPC线(ACPC):输入两个基准点,分别在前联合和后联合处。

  • 中线 (Midline):中线是定义大脑半球(中间矢状面)之间分界线的一系列点。

  • 输出转换 (OutputTransform):按照输入的参数进行配准计算并输出转换。


示例

1、载入数据如下

2、定义ACPC基准点,前后联合处分别为C1、C2。

3、定义中线系列基准点M1~M10,至少定义4个,分别位于C1、C2基准点层面的上、下层面。

4、输出转换(Output transform)

Transforms(转换)

Harden转换( 固定转换)之后的体数据

截取中间层面体数据的VR视图

GIF


三、思考题:

  1. 如何使用滤波模块 Resample Scalar/Vector/DWI Volume 将转换应用于体数据 ?

  2. 本章节中转换后的体数据,在Editor模块中进行标签图描绘时,会自动变为转换前如何解决?

    参考答案

    终极解决方案参见:OM基线调整后在Editor模块中编辑的一种解决方案

  3. 转换后的数据在Editor模块中用笔刷进行描绘时出现颜色不均现象有什么解决方案?

    解决方案参见高级会员专题:OM基线调整后在Editor模块中编辑的一种解决方案


天天练主题索引


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image ACPC Transform(Wiki)


Module Description(模块描述)

  • Calculate a transformation from two lists of fiducial points.

  • 从两个基准点列表中计算转换。


  • The ACPC line extends between two points, one at the anterior commissure and one at the posterior commissure. The resulting transform will bring the line connecting the two points horizontal to the AP axis.

  • ACPC线在两点之间延伸,一个在前连合处,另一个在后连合处。 产生的转换将使连接两点的线与AP轴水平连接。


  • The midline is a series of points defining the division between the hemispheres of the brain (the mid sagittal plane). The resulting transform will result in the output volume having the mid sagittal plane lined up with the AS plane.

  • 中线是定义大脑半球(中间矢状面)之间分界线的一系列点。 由此产生的转换将导致输出体数据的中间矢状面与AS平面对齐。


  • Use the Filtering module Resample Scalar/Vector/DWI Volume to apply the transformation to a volume.

  • 使用滤波模块 Resample Scalar/Vector/DWI Volume将转换应用于体数据。


Panel(面板)

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Parameters(参数)

  • Transform panel : Calculate a transform from midline and ACPC fiducial lists.

  • 转换面板:计算中线和ACPC基准列表的转换。

    ACPC Line (ACPC):ACPC line, a list of two fiducial points, one at the anterior commissure and one at the posterior commissure.

    ACPC线(ACPC):ACPC线,两个基准点的一个列表,一个在前联合,一个在后联合。

    Midline (Midline): The midline is a series of points defining the division between the hemispheres of the brain (the mid sagittal plane).

    中线 (Midline):中线是定义大脑半球(中间矢状面)之间分界线的一系列点。

    Output transform (OutputTransform):A transform filled in from the ACPC and Midline registration calculation.

    输出转换 (OutputTransform):从填入的ACPC线和中线配准计算进行转换。


  • Debug pane(调试窗格):

    Debug (debugswitch): Click this checkbox to see debugging output.

    调试(调试开关):点击此复选框查看调试输出。

你好,曹老师。想向你请教个问题?
我按照您说的步骤进入ACPC transform模块进行output transform输出时遇到图像不显示


请问是哪一步的问题?

曹老师,还有几个问题需要向你请教
1、大脑前(后)联合处这个位置具体在哪?如果我 在选ACPC线时,两个基准点的一个列表,本来是一个在前联合,一个在后联合,我可不可以选大脑任意横断面前后两点?
2、定义中线系列基准点M1~M10,您建议至少定义4个,分别位于C1、C2基准点层面的上、下层面。那最多个了,有没有限制?选点相应的大脑层面距离有没有限制,会不会影响矫正效果?
3、请问界面的字体怎么修改?
4、3Dslicer这个软件可不可以求出大脑体积具体数值了?

曹主任,就只显示这种图像

有可能是软件bug,可以手动选择相应序列进行显示,或者保存后退出软件再重新引导数据到软件中。

可以试一试,基本上是可行的。

多个的话会减少误差,最多定义过10余个。

界面字体在软件的设置里面更改,快捷键是Ctrl + 2,在Appearance选项中的Font and size中进行更改。

当然可以,对大脑进行建模,在Volumes模块中选中所建的大脑模型,在Information中查看Volume项目即可得知相应的体积数据。

谢谢曹主任细心的解答