天天练043-体数据模型剪切法(Volume clip with Model)2

一、学习素材: Lung_SlicerCN_001

二、学习目标:熟悉Volume clip with Model的用法

image Volume Clip With Model(Wiki)


  • Volume clip with model

    • Removes volume contents inside or outside the selected surface model
    • User may define and dynamically edit a 3D clipping surface by markup points (uses Delaunay triangulation, therefore it mostly generates convex surfaces)
    • For incremental clipping select the input volume also as output volume
  • 体数据模型剪切法

    • 移除选定曲面模型内部或外部的体数据内容
    • 用户可以通过标记点定义和动态编辑3D裁剪表面(使用Delaunay三角剖分算法,因此它主要生成凸曲面)
    • 对于增量裁剪,请将输入体数据也作为输出体数据

帮助:

  • Go to Volume clip with model module
  • Set:
    • Input volume: your input image
    • Clipping surface: Create new model
    • Clipping surface from markups: Create new MarkupsFiducial
    • Fill value: on CT: -1000 (radiological density of air on CT), on MR: 0 (typical background voxel brightness)
    • Output volume: Create new volume
  • Drop/move a few markup fiducials around your region of interest on a couple of axial slices
  • Click apply

  • 进入到模块Volume clip with model
  • 设置
    • 输入体数据(Input Volume) :你输入的影像
    • 剪切曲面( Clipping surface):创建新的模型
    • 从标记点剪切曲面(Clipping surface from markups):创建新的标记基准点
    • 填充值(Fill value):在CT上:-1000(CT上空气的CT值),在MR上:0(典型背景体素值)
    • 输出体数据(Output volume):创建新的体数据
    • 放置/移动在轴向切片上感兴趣区域周围的一些标记基准点
    • 点击应用

用法(二):

1、选中基准点工具(Fiducial),勾选持续模式(Persistent)

2、沿着胸部肋骨周围放置基准点,红、黄、绿色切片中至少选择2个。

3、如下图Clipping surface from markups选中“F”,至少已经放置一个基准点,此处才会显示相应选项。

image

4、点击应用后的最终结果如下图

5、操作步骤视频如下图,点击图片可查看清晰版。

GIF


三、思考题:

  1. 操作过程中基准点放错位置可以删除吗?如何删除某个或者全部基准点?

  2. 是否可以在切片视窗和3D视窗中调节基准点位置?

  3. 3D视窗中显示的蓝色模型如何隐藏或者删除?


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老师您好,貌似这个用来剪切体数据更方便,尤其是大范围,形状相对规则一些的

3D视图中也出现了蓝色的模型,在3D视图中也可以调整基准点的位置

蓝色模型的隐藏可以点击MODELS模块之后的第一个选项隐藏

1 Like

:+1: 在Segment Editor模块中也有类似效果的工具,更便捷一些,请关注后续天天练。

点了之后怎么变成了黑色的呀曹老师

,被圈进去的那些没有内容了呀

clip outside勾选,否则剪去的就是蓝色轮廓之内的部分。

好的,老师是我粗心了,忘记看这个了,我这几次退出的时候老师出现这个界面是我还有什么模块没有退出吗还是什么问题呢image

曹老师刚才你指导过后我自己也做出来了!谢谢指导

,就是感觉您用的哪个体积渲染的,光线比我们亮多了!

Volume Rendering高级设置,参见相关文章。

而且我发现我的这张图里面心脏没有显示出来,是哪里有问题呢

阈值设定问题

请问是哪个工具?

为什么我点完点后看不到他们连在一起的线啊,老师能分享下高级设置吗,您渲染的肋骨很漂亮


老师,这些基点和您的不一样,也没有线连在一起,该怎么操作呢?

第3步执行以下才行。


老师,按照流程操作完成后好像不太对,是哪里出问题了吗?

教程中的参数设置仔细看看,勾选Outside,剪切掉外面部分才行。参考教程第3步。