OM基线调整后在Editor模块中编辑的一种解决方案

素材 Slicercn003(CTA)

链接:https://pan.baidu.com/s/12eyksg5zk280HVmMkZx7aw

密码:g2in


目的:

1、 重新定义轴坐标并使之固定,使之可以在Editor模块中进行编辑。

2、 利用插值剪切法(可以不改变ROI,从而不进行剪切而只是进行插值操作)使各个方向的描绘变得顺滑。


1、导入数据如下:

2、选取笔刷等工具的时候,调整好的基线又出现问题了。

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3、在切片视窗中可见切片位置都变为Reformat,重新选取为Axial、Sagittal、coronal位置,但再次选取其他工具时基线又出现问题了。

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4、看来在Editor模块中是行不通了,改为Segment Editor模块试试。

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5、调好的基线没有变动,但是描绘的不是平面而是线条和网格,有没有其他的解决办法了。

答案就在天天练体数据剪切(Crop Volume),我翻译Wiki的时候无意中发现可以应用Crop Volume模块重新定义转换后的轴坐标,官网原文如下:

Define new axis directions for your image: Interpolated cropping option allows the output volume to have different axis directions that the original volume. The output volume’s axis directions will be aligned with the ROI widget’s axes. ROI widget axes can be rotated using Transforms module.

在Crop Volume模块中创建Input ROI显示如下,重建轴坐标时将会按照ROI的方向创建,所以不能采用这样的轴坐标。

首先需要定义ROI与OM基线的方向轴平行,可以采用Volume Rendering模块中的ROI。

之后在Crop Volume模块中进行如下操作,即可解决全部问题。

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调整好的数据,固化后,不是就可以了吗?

harden固化转换还是不能在Editor中进行编辑的。

Segment Editions可以吧,一直是这样做的。

是的,Segment Editor中处理方向轴没有问题,但是会出现网格样的染色,进行插值剪切之后就可以改善。

最初在做神经根和血管的时候,发现过这个问题。后来没注意,感觉没有上述情况。我下载数据试试

主任,固化后虽然在编辑时图像有所移位,但是由于是在同一坐标系中变形,匹配后重建见到各序列中解剖位置还是固定的。