天天练042-体数据模型剪切法(Volume clip with Model)1

一、学习素材: Slicercn002

二、学习目标:熟悉Volume clip with Model的用法

image Volume Clip With Model(Wiki)


  • Volume clip with model

    • Removes volume contents inside or outside the selected surface model
    • User may define and dynamically edit a 3D clipping surface by markup points (uses Delaunay triangulation, therefore it mostly generates convex surfaces)
    • For incremental clipping select the input volume also as output volume
  • 体数据模型剪切法

    • 移除选定曲面模型内部或外部的体数据内容
    • 用户可以通过标记点定义和动态编辑3D裁剪表面(使用Delaunay三角剖分算法,因此它主要生成凸曲面)
    • 对于增量裁剪,请将输入体数据也作为输出体数据

帮助:

  • Go to Volume clip with model module
  • Set:
    • Input volume: your input image
    • Clipping surface: Create new model
    • Clipping surface from markups: Create new MarkupsFiducial
    • Fill value: on CT: -1000 (radiological density of air on CT), on MR: 0 (typical background voxel brightness)
    • Output volume: Create new volume
  • Drop/move a few markup fiducials around your region of interest on a couple of axial slices
  • Click apply

  • 进入到模块Volume clip with model
  • 设置
    • 输入体数据(Input Volume) :你输入的影像
    • 剪切曲面( Clipping surface):创建新的模型
    • 从标记点剪切曲面(Clipping surface from markups):创建新的标记基准点
    • 填充值(Fill value):在CT上:-1000(CT上空气的CT值),在MR上:0(典型背景体素值)
    • 输出体数据(Output volume):创建新的体数据
    • 放置/移动在轴向切片上感兴趣区域周围的一些标记基准点
    • 点击应用

用法(一):

1、对颅骨、背板、定位帖进行建模操作如下图

2、将体数据用建好的模型去剪切,此种情况下Clipping Surface from markups参数不用更改

3、剪切后的切片视图显示如下图

4、三维视图(VR)如下

GIF


用法(二):

见下一章节的天天练


三、思考题:

  1. 用模型剪切体数据的方法中Clip outside是否勾选的区别是什么?

  2. 如示例中剪切后的体数据怎样的方法去除皮肤软组织而只保留脑组织显影?


天天练主题索引


这个练习没弄明白。我剪切后切片视图的颅骨仍是黄颜色,并没能去除颅骨?这是应为什么原因?

建模后扩大一下,否则去除不彻底,而导致仍有薄层的颅骨显影。如果电脑配置好可以在Segment Editor模块中用剪刀进行操作会更好。先把model导入到Segment Editor中再进行编辑。后续章节会讲到。

扩大是指什么扩大?

天天练032-Editor工具之缩小和扩大

老师 扩大建模后 应用clip仍是这样 不知怎么回事 麻烦给讲一下 谢谢

问题描述尽量详尽,这样子也没看出来哪里不妥啊。

如果你的问题是为什么颅骨没有去除?将染色部分隐藏即可。

好的 明白了

曹老师我试了一下,第一次是点了clip outside 然后点应用裁剪出来的只剩下头骨的部门,没有电clip outside 才出现了你教程里我们想要的那一部分,

,如图所示是我没有电outside的勾裁剪出来的,但是您这边说的vr显示是用的是3d渲染里面的功能吗,还是仍然用的是editor里面的绘图工具呢,我想你应该用的是3d渲染里面的工具 ,我这边显示出来的没有您做的那种效果哎,请老师解惑

今天重新练习了一遍,不知道是哪里出错了,曹老师

我也点了clip outside,但是露骨部分还是没有去掉,而且染色部分忘了怎么隐藏呀

刚才表达有误

,我没有点击clip outside ,但是这个绿色怎么隐藏呢,好像忘记了

请问该怎么隐藏染色的部分?初学者不懂的太多,不好意思了。

在models模块里面取消显示相应的model。


怎么有inside和outside呢,请老师指教

选择inside,剪切后保留的部分为模型覆盖部分,选择Outsede则相反。

好的,感谢老师指导