1:DWIConvert调试
2保存nrrd.格式
3有问题
4mask计算出错
老师帮忙看下哪有问题,谢谢
看图像不是DTI序列啊! DTI序列是一组具有弥散方向和b值参数的DWI数据集,也不是普通的DWI数据扫描。
DWI数据试试,其他都不是。
重要提示:PACS系统下载的数据是经过软件处理过的最终结果,而非原始数据,另外因缺少梯度方向参数,不能用于DTI重建。解决方案是MRI主机上拷贝数据或刻盘或新的U盘拷贝。
自己寻求解决方案之前是否每个数据都试过了?
第2和第3是DTI处理过程中的半成品数据,不能应用,第1种看着也不像DWI数据。
最有效的方法是应用模块DWIConvert导入数据试试,能够正常导入,而且有梯度方向参数,就对了。
DWIconvet能导入,但是DWI ComPonent调不了,我感觉还是少了东西,用医院的机子目前这些序列就可以重建出来,不太理解,或者中间还需要转换?
您能不能告诉我下数据采集方法或者要求?因为我用3dslicer自带的示例数据可以重建出来。
有些细节问题不太理解,如果方便还请您指点一下。谢谢谢谢!
MR机子做的
3dslicer自带DWI数据我做的
在MR机子里拷贝的是否为DWI?
缺少梯度方向参数就是这种情况!DTI数据可以理解为一组具有梯度方向参数的DWI数据集,转换后的图像是下图这样的。
还可以用下面的方法验证一下。将DWIConvert模块转换后的DWI数据存成nhdr格式,找到存盘目录,用写字板或记事本打开nhdr文件查看具体参数,如果没有梯度方向参数或者是错误的梯度参数,这样的“原始数据”不能用于DTI的重建。
具体看机器品牌和设置寻求解决方案,以我们飞利浦3.0T机器为例,从工作站导出数据不能用于重建,因为缺少弥散数据。解决方案是直接在操作的机器上把数据拷贝出来,这是我们技师的大力支持,反复研究解决方案,用了差不多1个月的时间才解决的。
我还咨询了3DSlicer fMRI研发小组的张博,回复如下:
老师电脑的存盘目录一般在哪个文件夹里
存盘目录可以自己设置,我的是在D盘,SSD硬盘分两个区,C盘安装系统,D盘安装软件,读取速度快。
老师,请教您,重建出来的脑神经束导出stl打开是空的?请问像脑神经束怎么实现stl导出,谢谢
抽时间写一下吧,这个需要数据验证,以前也没有进行导出操作。你先看看官网的教程。
提供的截图显示缺少梯度参数。数据扫描的时候只要是DTI序列,都会有梯度参数和b值的,问题不在于扫描机参数设置,在于你是否将原始的所有数据都进行了拷贝,部分数据参数的取得,求助于工程师才能解决问题。
您好,老师梯度值需要单独拷贝,还是说DWI数据没拷贝全
梯度参数与机器的品牌等有关,有的是与体数据在一起,有的是单独的一个文件,具体请咨询工程师。
曹老师,西门子3T的机器,梯度参数可以随数据一起拷贝来吗?还是需要单独拷贝,您知道吗
与机器品牌、机器型号及工作站的软件版本都有关,我们飞利浦3.0机器更换工作站软件之后,就只能在操作的机器上刻盘使用,具体咨询工程师或技师。
梯度参数信息是包含在DICOM格式文件中的,3DSlicer可以读取。拷贝的数据有可能不含有这部分信息,则无法进行DTI重建。可以将数据拷贝一份看看是否包含梯度信息。