一、纤维束成像:
这个模块可以对感兴趣的区域进行纤维束成像,可以在FA图中定义感兴趣区域(ROI),以胼胝体纤维束成像进行讲解。
应用到模块
二、胼胝体标签图:
1、在切片视窗控制界面将前景层选为DTI,透明度系数设置为0.40。背景层选为FA,其叠加后效果如下图所示。
2、进入到Editor模块,主体数据选取FA,融合体数据自动命名为FA-label。
3、利用绘画工具对胼胝体进行描绘。
4、按照上面方法对胼胝体至少描绘3~5个层面。
三、参数设置:
Parmeters Node:参数节点
- Parameters(参数):选择模块的现有设置或创建一个新的设置。
- Presets(预设):为模块选择Slicer4或Slicer3参数设置,目前版本共有3个选项。
- Slicer4 Interactive Seeding Defaults:默认Slicer4交互种子。
- Slicer3 Labelmap Seeding Defaults:默认Slicer3标签映射种子。
- Slicer3 Fiducial Seeding Defaults:默认Slicer3基准点种子。
IO:IO面板-输入输出参数设置
- Input DTI Volume(输入DTI数据):选择现有的张量数据(DTI)。
- Output Fiber Bundle(输出纤维束):默认为“FiberBundle”,示例选择“Create new FiberBundle as…”并命名为“FB-Brain”
Seeding:种子
- Input Fiducials,Model or Label Map:选择一个现有的基准点列表、模型或标签映射体数据作为跟踪的种子。
- Seeding Label Value:种子标签值,默认为1。
- Seed Spacing(mm):种子间距,表示选取种子间的距离,单位为毫米,这个功能只有在没有勾选使用索引空间复选框时才有效。
- Use Index Space:使用索引空间,勾选后在IJK中选择体素作为种子。
- Random Grid:随机网格,勾选后能够随机放置种子点。
Update:更新
- 点击“Update”即可在三维视窗中观察纤维束成像情况,调节各参数后,需要重新点击“Update”。
四、胼胝体成像方法:
参数设置如下,其他参数为默认。
- Presets:预设默认为 Slicer4 Interactive Seeding Defaults
- Input DTI Volume:选择张量数据DTI
- Output Fiber Bundle:选择“Create new FiberBundle as…”并命名为“FB-CC”
操作步骤:
备注:点击图片可以查看清晰大图。
五、参数调节:
Seed Spacing(种子间距)表示选取种子间的距离,单位为毫米,这个功能只有在没有勾选Use Index Space(使用索引空间)复选框时才有效。
备注:点击图片可以查看清晰大图。