一、皮质脊髓束纤维束成像:
应用这个模块放置种子点,对皮质脊髓束进行纤维束成像。
解剖复习:
动画演示皮质脊髓束(来源于网络,仅作演示之用,勿下载及传播复制,如有侵权请告知删除)
http://p77dnje4w.bkt.clouddn.com/神经解剖学%20-%203D中的皮质脊髓束.mp4
此皮质脊髓束纤维束成像应用的模块有和
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二、Parmeters Node:参数节点
预设默认选择Slicer4 Interactive Seeding Defaults(适用于Slicer 4.0版本以上,建议应用4.8.1以上的版本进行本教程的练习)
- Parameters(参数):选择模块的现有设置或创建一个新的设置。
- Presets(预设):默认为“Slicer4 Interactive Seeding Defaults” (Slicer4交互种子),不用更改。
三、Seeding:种子
- Input Fiducials,Model or Label Map:此演示将基准点作为种子,默认为“F”,必须放置一个基准点(Fiducial)之后,此菜单才可进行选择。
背景体数据选择“FA”,在冠状切片视图中投射纤维处放置种子点,如下图所示:
- Fiducial Region Size(mm):种子点周围的区域大小,数值越大,种子点纤维束成像的范围越广。
- Fiducial Seeding Step Size:种子点步长,数值越大,纤维束成像显示的细节越少。
- Max Number of Seeds:种子点的最大数量,默认值为100个,超过设置值的种子点将不再成像。
- Seed Selected Fiducials Only:仅被选择的基准点作为种子点或者全部都作为种子点的选项。
四、Update(check for interactive):更新(实时交互查看)
勾选时可以看到随着种子点的移动,纤维束成像实时在变化。取消勾选时,更改参数后需要手动进行更新,纤维束成像才会有变化。
五、Tratography Parameters:纤维束参数
- Threshold Type:阈值类型,Fractional Anisotropy
- Seeding Threshold:种子阈值
- Stopping Threshold:停止阈值
- Integration Step Length(mm):积分步长,表示同一根纤维上点之间的距离,单位为毫米。
六、Advanced Options:高级选项
- Minimum Length(mm):表示成像纤维的最小长度,仅选择大于此值的区域,单位为毫米。
- Maximum Length(mm):表示成像纤维的最大长度,仅选择小于此值的区域,单位为毫米。
- Stopping Track Curvature:停止追踪曲率,当纤维的曲率半径小于此值时纤维追踪将会停止。
- Create Tracts Initially As:选择Tubes(管)或Lines(线)。